A génszerkesztő nukleázok és deaminázok célspecifitásának értékelése és fokozása

A biokémia éves áttekintése

génszerkesztő

Vol. 88: 191-220 (A kiadás dátuma: 2019. június)
Első közzététel előzetes áttekintésként, 2019. március 18-án
https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-013118-111730

Daesik Kim, 1, * Kevin Luk, 2, * skót A. Wolfe, 2 és Jin-Soo Kim, 1,3

Absztrakt

A programozható nukleázokat és deaminázokat, amelyek magukban foglalják a cink-ujj nukleázokat, a transzkripciós aktivátor-szerű effektor nukleázokat, a CRISPR RNS-vezérelt nukleázokat és az RNS-vezérelt bázisszerkesztőket, ma már széles körben alkalmazzák a sejtek és organizmusok genomjának célzott módosítására. Ezek a génszerkesztő eszközök rendkívül ígéretesek a terápiás alkalmazások terén. Fontos, hogy ezek a nukleázok és deaminázok a célközönséghez közeli rokon DNS-szekvenciák felismerésével a célon kívüli aktivitást mutathatnak, ami helyi mutagenezis vagy genomiális átrendeződések formájában a genomban járulékos károsodást eredményezhet. A programozható enzimek ezen osztályainak terápiás genomszerkesztő alkalmazásához elengedhetetlen a genom egészére kiterjedő, célon kívüli aktivitás mérése és korlátozása. Itt megvitatjuk ezeknek a rendszereknek a célon kívüli tevékenységének legfontosabb meghatározóit. Különböző sejtalapú és sejtmentes módszereket írunk le a genom egészére kiterjedő, nem célhelyek azonosítására, valamint különféle stratégiákat, amelyeket a programozható génszerkesztő enzimek célon kívüli aktivitásának csökkentésére fejlesztettek ki.

Kulcsszavak

  • Asztal 1 -Számítógépes prediktív algoritmusok felsorolása a gRNS célon kívüli elemzéséhez
  • 2. táblázat -Számos elfogulatlan genom-módszer összehasonlítása egyetlen közös célhelyen, a VEGFA TS1-ben

Ábra Helyszínek