Kovalensen kötött fluoratomok hidrogénkötési kölcsönhatásai: a kristálytani adatoktól a GRID erőtér új szögfüggvényéig

Publikációs előzmények

Cikk nézetek

Altmetrikus

Idézetek

A cikknézetek a teljes szöveges cikkletöltések COUNTER-kompatibilis összege 2008 novembere óta (mind PDF, mind HTML) az összes intézményben és magánszemélyben. Ezeket a mutatókat rendszeresen frissítik, hogy tükrözzék az elmúlt napokig tartó felhasználást.

Az idézetek a cikkre hivatkozó egyéb cikkek száma, a Crossref által kiszámítva és naponta frissítve. További információ a Crossref hivatkozási számáról.

Az Altmetric Attention Score egy kvantitatív mértéke annak a figyelemnek, amelyet egy kutatási cikk online kapott. A fánk ikonra kattintva az altmetric.com oldal egy oldalt tölt be, amely további részleteket tartalmaz az adott cikk pontszámáról és a közösségi média jelenlétéről. További információ az Altmetric Attention Score-ról és a pontszám kiszámításáról.

Absztrakt

Az évek során a GRID erőteret úgy állították be, hogy illeszkedjen a kristályszerkezetek kísérleti megfigyeléseihez. Ez a cikk leírja a szerves fluorok hidrogénkötési mintázatának meghatározását a Fehérje Adatbank teljes körű vizsgálata alapján. Megvizsgáltuk és geometriai szempontból megvizsgáltuk az összes PDB komplexet, amelynek fehérje szerkezete kokristályosított fluortartalmú ligandumokat tartalmaz. A statisztikák alkalmazásával a hidrogénkötés geometriáját a fluor szögének eloszlási függvényeként írták le: ennek következtében új specifikus szögfüggvényt határoztak meg és illesztettek be a GRID programba, hogy megbecsüljék a fluor-hidrogén kötések ligandum-fehérje kötődésre gyakorolt hatását. A PDB-ből összegyűjtött összes fluortartalmú ligandumot a megfelelő fehérjekötő helyükön dokkolták: a fluor-hidrogénkötés hozzájárulásának bevezetése javítja a dokkolási kísérletek eredményeit a pontosság és a rangsorolás szempontjából.

Levelezési cím. Telefon: +39 075 5855550, Fax: +39 075 45646, e-mail: [e-mail védett]