A bél mikrobiómájának metaanalíziséből kiderül, hogy a dysbiosis független a testtömeg-indextől a kockázat előrejelzésében

A túlsúlyhoz és az elhízáshoz kapcsolódó egészségügyi kockázatok közé tartozik a cukorbetegség, a szív- és érrendszeri betegségek és a rák. Az Országos Rákkutató Intézet becslései szerint az összes új rák 3,2% -a elhízás következménye, és hogy a férfiak rákos megbetegedéseinek 14% -át, a nőknél pedig 20% -át elhízásnak tulajdonítják. esetek és 50 000 rákos haláleset évente, ezzel a második leghalálosabb rák az USA-ban (SEER). Számos epidemiológiai tanulmány kimutatta, hogy a felnőttkori elhízás 1,2-szeresére növeli a vastagbélrák kockázatát, az elhízás az összes vastagbélrák előfordulásának 14–35% -át teszi ki.1 3–5 Ezen okok miatt elengedhetetlen az új módszerek az elhízás terhének csökkentésére a vastagbélrák kockázata és halálozása szempontjából. Három vizsgálati terület fontos a CRC etiológiájának megértéséhez: az elhízás, a gyulladás és a mikrobiom.

Számos tanulmány szerint a mikrobiális taxonok szerepet játszanak a vastagbélrák etiológiájában. 6–9 Az azonban teljesen ismeretlen, hogy a mikrobiom hozzájárul-e az elhízással összefüggő vastagbélrák kialakulásához az emberekben. Az egyik módszer, amely ígéretesnek bizonyult a korai stádiumú vastagbélrák azonosítására, a gasztrointesztinális traktus (GI) mikrobiomjának elemzése. Számos tanulmány vastagbélrákkal társult mikrobiotát talált a rák előtti vastagbélszövetben (adenomák), és a mikrobióm segítségével megkülönböztették a rákot megelőző adenomákat a CRC-től, bár változó pontossággal. fejlődés, beleértve az enterotoxigén Bacteroides fragilis (ETBF) és a Fusobacterium nucleatum.8 9 13–15

Több bizonyíték is bizonyítja, hogy mind az étrend, mind az elhízás jelentősen megváltoztathatja a mikrobiómát. Ebből a tanulmányból képesek voltak összefoglalni a humanizált egerek elhízási fenotípusát. Az SCFA-k, amelyekről később kimutatták, hogy eltörlik a lipidek tárolását.20 23 További kutatások szükségesek azonban a mikrobiom-gazda kapcsolat azonosításához elhízott egyéneknél.

Ebben a tanulmányban több olyan nyilvánosan elérhető adatsort használtunk fel, amelyekben széklet vagy szöveti mikrobiom szekvenálást végeztek, és amelyből a testtömeg-index (BMI) is elérhető volt. A QIIME (16S rRNS) és a Pathoscope (teljes genom szekvenálás [WGS]) bioinformatikai eszközök segítségével feldolgoztuk a 16S rRNS és WGS leolvasásokat, és mindegyik mintából taxonómiai profilt vezettünk le. Ezeket a taxonokat és az anyagcsere útvonal információit használtuk annak meghatározására, hogy egy taxonómiai aláírás vagy specifikus taxonok társulnak-e mind az elhízáshoz, mind a CRC-hez. Ezen elemzés alapján megfigyeltük, hogy az elhízással járó dysbiosis független a CRC-vel társult dysbiosistól.

Mód

Minta populáció

Ehhez a tanulmányhoz azonosítunk olyan vizsgálatokat, amelyek relevánsak az elhízás és a CRC kapcsolatának értékeléséhez, a mikrobiomot használva független változóként. Öt olyan vizsgálatot azonosítottak, amelyek mind a BMI-t, mind a székletben vagy szövetben lévő mikrobiómát értékelték adenómás, karcinómás vagy betegség nélküli egyéneknél (1. táblázat és online 1. kiegészítő anyag). Ezek közül három vizsgálat 16S rRNS-szekvenálást végzett székleten vagy szöveten, három pedig WGS-t székleten vagy szöveten, egy RNS-szekvenálást alkalmazva. Az egyik vizsgálat mind a 16S rRNS-t, mind a WGS-t szöveteken és székleten végezte.