A molekuláris eszközök rovarevő madarak étrendjét tárják fel a ragadozó széklet anyagából

Absztrakt

Ez az előfizetéses tartalom előnézete. Jelentkezzen be a hozzáférés ellenőrzéséhez.

Hozzáférési lehetőségek

Vásároljon egyetlen cikket

Azonnali hozzáférés a teljes cikk PDF-hez.

Az adószámítás a fizetés során véglegesül.

Feliratkozás naplóra

Azonnali online hozzáférés minden kérdéshez 2019-től. Az előfizetés évente automatikusan megújul.

Az adószámítás a fizetés során véglegesül.

Hivatkozások

Altschul SF, Gish W, Miller W és mtsai (1990) Alapvető helyi igazítás kereső eszköz. J Mol Biol 215: 403–410

Beal F (1915) Az Egyesült Államok vörösbegyei és kékmadarai tápláléka. Amerikai Mezőgazdasági Minisztérium Biológiai Felmérés Közlönye, 171. évfolyam, 151–175

Bohmann K, Monadjem A, Noer CL és mtsai (2011) Két afrikai szabadfarkú denevér (Molossidae) molekuláris étrend-elemzése nagy áteresztőképességű szekvenálással. PLoS ONE 6: e21441. doi: 10.1371/journal.pone.0021441

Bowles E, Schulte PM, Tollit DJ és mtsai (2011) Az elfogyasztott zsákmány aránya a széklet DNS-ből valós idejű PCR segítségével meghatározható. Mol Ecol Resour 11: 530–540

Carlisle JD, Holberton RL (2006) A széklet és a regurgitált minták relatív hatékonysága az étrend és a fogkő emetikus vándorló madarakra gyakorolt káros hatásainak értékelésére. J Field Ornithol 77: 126–135. doi: 10.1111/j.1557-9263.2006.00032.x

Clare EL, Fraser EE, Braid HE és mtsai (2009) A generalista ragadozó, a keleti vörös denevér menüjének fajai (Lasiurus borealis): molekuláris megközelítés alkalmazása az ízeltlábúak zsákmányának kimutatására. Mol Ecol 18: 2532–2542. doi: 10.1111/j.1365-294X.2009.04184.x

Clare EL, Barber BR, Sweeney BW és mtsai (2011) Helyi étkezés: Az élőhely hatásai a kis barna denevérek étrendjére (Myotis lucifugus). Mol Ecol 20: 1772–1780. doi: 10.1111/j.1365-294X.2011.05040.x

Corse E, Costedoat C, Chappaz R et al (2010) PCR-alapú módszer étrendelemzésre édesvízi organizmusokban, 18S rDNS vonalkódolással a székleten. Mol Ecol Resour 10: 96–108. doi: 10.1111/j.1755-0998.2009.02795.x

Deagle BE, Eveson JP, Jarman SN (2006) A nagymértékben lebomlott mintákból kinyert DNS károsodásainak mennyiségi meghatározása - esettanulmány a székletben lévő DNS-ről. Front Zool 3:11

Deagle BE, Gales NJ, Evans K et al (2007) A tengeri madarak étrendjének tanulmányozása a széklet genetikai elemzésével: esettanulmány a makaróni pingvinekről (Eudyptes chrysolophus). PLoS ONE 2: e831. doi: 10.1371/journal.pone.0000831

Deagle BE, Kirkwood R, Jarman SN (2009) Az ausztrál medvefóka étrend elemzése a zsákmány DNS-jének székletben való piroszekvenálásával. Mol Ecol 18, 2022–2038. doi: 10.1111/j.1365-294X.2009.04158.x

Deagle BE, Chiaradia A, McInnes J, Jarman SN (2010) A széklet DNS-jének piroszekvenálása a kis pingvinek étrendjének meghatározásához: mi megy bele, mi jön ki? Conserv Genet 11: 2039–2048. doi: 10.1007/s10592-010-0096-6

Folmer O, Black M, Hoeh W és mtsai (1994) DNS-primerek a mitokondriális citokróm c-oxidáz I. alegység amplifikációjához különböző metazoa gerinctelenekből. Mol Mar Biol Biotech 3: 294–299

Guinan JA, Gowaty PA, Eltzroth EK (2008) Western Bluebird (Sialia mexicana). Észak-Amerika madarai online. In: Poole A (ed) Ithaca: ornitológiai cornell labor; észak-amerikai madarakról szerezték be online: http://bna.birds.cornell.edu/bna/species/510. doi: 10,2173/bna.510

Howard E, Heiser J (2004) Mi van benne: anatómia és fiziológia. In: Podulka S, Rohrbaugh R, Bonney R (eds) Cornell lab of ornithology handbook of bird biology, 4. fejezet, 2. edn. Princeton University Press, Ithaca

Jarman SN, Gales NJ, Tierney M és mtsai (2002) DNS alapú módszer a krill fajok azonosítására és alkalmazására a tengeri gerinces ragadozók étrendjének elemzésére. Mol Ecol 11: 2679–2690

King RA, Read DS, Traugott M, Symondson WOC (2008) A ragadozás molekuláris elemzése: a DNS-alapú megközelítések legjobb gyakorlatának áttekintése. Mol Ecol 17: 947–963. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03613.x

Leonard ML, Teather KL, Horn AG és mtsai (1994) A nyugati kékmadarak ellátása nem kapcsolódik az utódok neméhez. Behav Ecol 5: 455–459. doi: 10.1093/beheco/5.4.455

Levey DJ, Karasov WH (1992) Emésztési moduláció egy szezonális takarmányevőben, az amerikai RobinTurdus migratorius). Am J Physiol 262: G711 – G718

Levey DJ, Tewksbury JJ, Bolker BM (2008) A távolsági vetőmag elterjedésének modellezése heterogén tájakon. J Ecol 96: 599–608. doi: 10.1111/j.1365-2745.2008.01401.x

Mellott RS, Woods PE (1993) Továbbfejlesztett ligatúra technika fészkelő madarak étrendi mintavételéhez. J Field Ornithol 64: 205–210

Moody DT (1970) Módszer táplálékminták előállítására rovarevő madaraktól. Auk 87: 579

Murray DC, Bunce M, Cannell BL és mtsai (2011) DNS-alapú széklet-étrendi elemzés: a qPCR és a nagy áteresztőképességű szekvenálási megközelítések összehasonlítása. PLoS ONE 6: e25776. doi: 10.1371/journal.pone.0025776

Neuweiler G (2000) A denevérek biológiája. Oxford University Press, New York

Newsome SD, Del Rio CM, Bearhop S, Phillips DL (2007) Az izotóp-ökológia rése. Front Ecol Environ 5: 429–436. doi: 10.1890/060150.01

Oehm J, Juen A, Nagiller K és mtsai (2011) Molekuláris szkatológia: hogyan lehetne javítani a zsákmány DNS kimutatásának sikerét a madárszékletben? Mol Ecol Resour 11: 620–628

Pompanon F, Deagle BE, Symondson WOC et al (2011) Ki mit eszik: étrend értékelése a következő generációs szekvenálás segítségével. Mol Ecol. doi: 10.1111/j.1365-294X.2011.05403.x

Razgour O, Clare EL, Zeale MRK és mtsai (2011) A nagy áteresztőképességű szekvenálás betekintést nyújt az erőforrások felosztásának mechanizmusaiba rejtélyes denevérfajokban. Ecol Evol 1: 556–570. doi: 10.1002/ece3.49

Scupham A, Jones J, Wesley I (2007) DNS-extrakciós módszerek összehasonlítása a pulykaecec mikrobiota elemzéséhez. J Appl Microbiol 102: 401–409

Smith MA, Eveleigh ES, McCann KS és mtsai (2011) Számszerűsített táplálékháló vonalkódolása: rejtjelezés, fogalmak, ökológia és hipotézisek. PLoS ONE 6: e14424. doi: 10.1371/journal.pone.0014424

Symondson WOC (2002) A ragadozók molekuláris azonosítása ragadozó étrendben. Mol Ecol 11: 627–641

Valentini A, Miquel C, Nawaz MA és mtsai (2009) Új perspektívák a diétanalízisben, DNS-vonalkódolás és párhuzamos piroszekvenálás alapján: a trnL megközelítés. Mol Ecol Resour 9: 51–60. doi: 10.1111/j.1755-0998.2008.02352.x

Wilson JJ, Rougerie R, Schonfeld J és mtsai (2011) Ha a fajegyeztetések nem állnak rendelkezésre, a DNS-vonalkódokat helyesen rendelték-e a magasabb taxonokhoz? sphingos lepkék felhasználásával végzett értékelés. BMC Ecol 11:18

Zeale MRK, Butlin RK, Barker GLA és mtsai (2011) Taxon-specifikus PCR DNS vonalkódoló ízeltlábúak zsákmányához denevér székletében. Mol Ecol Resour 11: 236–244. doi: 10.1111/j.1755-0998.2010.02920.x

Köszönetnyilvánítás

A Nemzeti Tudományos Alapítvány (DBI-1103583) és a Kaliforniai Egyetem Mezőgazdasági Kísérleti Állomása támogatást nyújtott ehhez a projekthez. Köszönjük Ron Rosenbrand-nak, Diane Kenworthy-nek, Robert Burney-nek, Joel Peterson-nak, az alapkőzet-szőlőskerteknek és a Spring Mountain-szőlőskerteknek a kékmadarak fészkeihez való hozzáférést. Köszönjük Marie Lefebvre-nek, hogy testreszabott egy Perl-szkriptet a BLAST azonosítás megszerzéséhez a szekvenciákhoz. Négy névtelen lektor hasznos megjegyzést fűzött a kézirat korábbi verzióihoz.

Szerzői információk

Abhineet M. Sharma

Jelenlegi cím: Orvostudományi Kar, Saint Louis Egyetem, 221 N. Grand Blvd., St. Louis, MO, 63103, USA

Hovatartozások

Környezettudományi, Politikai és Menedzsment Tanszék, Kaliforniai Egyetem, 130 Mulford Hall, Berkeley, CA, 94720, USA

Julie A. Jedlicka, Abhineet M. Sharma és Rodrigo P. P. Almeida

A PubMed Google Scholar alkalmazásban is kereshet erre a szerzőre