Az étrend és más környezeti tényezők alakítják a halbél baktériumközösségeit egy eutrofikus tóban

Az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltségének Szisztematikai és Ökológiai Intézete, Novoszibirszk, Oroszország

tényezők

Elena N. Kashinskaya, Állatok Szisztematikai és Ökológiai Intézete, az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltsége, Frunze St. 11, Novoszibirszk, 630091, Oroszország.

Az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltségének Szisztematikai és Ökológiai Intézete, Novoszibirszk, Oroszország

Szibériai Szövetségi Egyetem, Krasznojarszk, Oroszország

Kémiai Biológiai és Fundamentális Orvostudományi Intézet, Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltsége, Novoszibirszk, Oroszország

Papanin Belvizek Biológiai Intézete, Orosz Tudományos Akadémia, Borok, Nekouzskii raion, Jaroszlavszkaja terület, Oroszország

IRTA ‐ SCR, San Carlos de la Rapita, Tarragona, Spanyolország

Az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltségének Szisztematikai és Ökológiai Intézete, Novoszibirszk, Oroszország

Tomszki Állami Egyetem, Tomszk, Oroszország

Az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltségének Szisztematikai és Ökológiai Intézete, Novoszibirszk, Oroszország

Elena N. Kashinskaya, Állatok Szisztematikai és Ökológiai Intézete, az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltsége, Frunze St. 11, Novoszibirszk, 630091, Oroszország.

Az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltségének Szisztematikai és Ökológiai Intézete, Novoszibirszk, Oroszország

Szibériai Szövetségi Egyetem, Krasznojarszk, Oroszország

Kémiai Biológiai és Fundamentális Orvostudományi Intézet, Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltsége, Novoszibirszk, Oroszország

Papanin Belvizek Biológiai Intézete, Orosz Tudományos Akadémia, Borok, Nekouzskii raion, Jaroszlavszkaja terület, Oroszország

IRTA ‐ SCR, San Carlos de la Rapita, Tarragona, Spanyolország

Az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltségének Szisztematikai és Ökológiai Intézete, Novoszibirszk, Oroszország

Tomszki Állami Egyetem, Tomszk, Oroszország

Absztrakt

Ennek a munkának a célja a vadon élő halfajok bélmikrobiális sokféleségének vizsgálata volt, különböző táplálkozási szokásokkal, emésztési fiziológiával (gyomor vs. agastrica) és összehasonlító szerkezeti elemzést nyújtanak a környezetükben található mikrobaközösségekről (élelmiszerek, víz, üledékek és makrofiták).

Módszerek és eredmények

A halbél mikrobiotáját és zsákmányaikat a 16S riboszomális RNS gének következő generációs nagy áteresztőképességű szekvenálásával vizsgálták. A PCoA-pontszámokon alapuló szóródási diagram megmutatta, hogy a mikrobiota három csoportot alkotott: (i) gyomor- és bélnyálkahártya (IM), (ii) gyomor- és béltartalom (IC) és (iii) zsákmány és környezet. Az ANOSIM-ot használó összehasonlítások szignifikáns különbségeket mutattak a mindenevő, zoobentivoros, zooplanktivorous-piscivor halak IC-k között (P ≤ 0,1). Nem észleltek szignifikáns különbséget az ugyanazon csoportok nyálkahártyájábanP > 0 · 1).

Következtetések

Sem a fajok közötti különbségek a halak étrendjében, sem azok filogenetikai helyzetük nem befolyásolták az IM mikrobiomját, de az étrend mégis befolyásolta az IC mikrobiotájának összetételét.

A tanulmány jelentősége és hatása

Az adatok azt mutatják, hogy a halak olyan baktériumcsoportokat hordoztak magukban, amelyek nem tükrözik teljesen a környezet vagy a zsákmány mikrobiotáját.