De novo csonkoló variáns az NSD2gene-ben, ami atipikus Wolf-Hirschhorn-szindróma fenotípushoz vezet

Absztrakt

Háttér

A Wolf-Hirschhorn szindróma (WHS) egy összefüggő gén szindróma, amelyet az egyes betegeknél nagymértékben változó méretű részleges 4p deléció okoz. A WHS alapvető fenotípusát a növekedés késleltetésének, a tipikus arcjellemzőknek, az értelmi fogyatékosságnak és a rohamoknak az összefüggése határozza meg. A WHS kritikus régióját (WHSCR) leszűkítették és NSD2 e 200 kb-os régióba esik. Csak négy beteg van NSD2 a változatokat részletesen dokumentálták fenotípusos jellemzőkkel.

Eset bemutatása

Ebben egy 12 éves fiú esetét számoltuk be fejlődésben. Diszmorf arcvonásai voltak, köztük tágra nyílt szemek, kiemelkedő orrhíd, amely folytatódik a homlokán, rendellenes fogzás és mikrognátia. Enyhe klinikakaktikája volt mindkét kezén. A teljes exom szekvenálást felhasználva azonosítottunk egy patogén mutációt NSD2 perifériás vér DNS-ből izolált [c.4029_4030insAA, p.Glu1344Lysfs * 49]. Ennek a változatnak a Sanger általi megerősítése de novo csonkító változatként tárta fel a családban.

Következtetés

Itt egy fiúról számoltunk be, de novo csonkító variánssal NSD2 atipikus klinikai jellemzőkkel, összehasonlítva a 4p16.3 delécióval kapcsolatos WHS-szel. Megállapításunk tovább alátámasztotta a csonkító variánsok patogenezisét NSD2 és körülhatárolta az ezen változatok által okozott lehetséges tünetek spektrumát.

Háttér

A Wolf-Hirschhorn-szindrómát (WHS) először 1965-ben írták le veleszületett rendellenességként/mentális retardációként, a 4. kromoszóma p-terminálisán történő részleges deléció következtében [1]. A WHS (OMIM 194190) betegeket kraniofaciális jellemzőkkel jellemezték, ideértve a mikrokefáliát, a „görög harcos sisak” megjelenését széles orrhíd, széles távolságban elhelyezkedő és kiemelkedő szemek, valamint különálló száj lefelé fordított sarkokkal, rövid Philtrum és micrognathia [2]. A WHS-betegeknél megfigyelt egyéb gyakori jellemzők az intrauterin növekedés retardációja, a szülés utáni növekedési hiány, az értelmi fogyatékosság, a hipotónia, a görcsrohamok, az etetési nehézségek és az izom hipotrófiája [3]. Leginkább a 4p deléció mértékétől függően a további klinikai tünetek közé tartoznak a súlyos fejlődési rendellenességek, például középvonalbeli hibák, veleszületett szívhibák, vese- és csontrendszeri rendellenességek [4].

A WHS-ben diagnosztizált több eset átfedő régiói segítettek eldönteni a WHS kritikus régióját, nevezetesen a WHSCR1 és a WHSCR2, amelyet a 4p16.3-on 200 kb méretű régióra szűkítettek le [5, 6]. A tipikus WHS-t még klinikai fenotípusának enyhe formájában is nagyrészt feltételezik, hogy multigén rendellenesség. Így sem a WHSCR, sem a WHSCR-2 nem került megállapításra a WHS meghatározott genetikai okaként, de lehetővé tették a lehetséges jelölt gének további feltárását. De novo variáció NSD2 (más néven WHSC1) úgy gondolják, hogy összefügg a betegségekkel, mivel a fenotípusos jellemzők széles skálájával rendelkező betegeknél azonosították, beleértve a fejlődés késleltetését, az autizmust és a veleszületett szívbetegségeket. Legutóbb jelentett esetek de novo csonkító variánsokkal NSD2 és a fenotípusos részletek új betekintést nyújtottak a WHS genetikai okaiba [7,8,9]. NSD2 úgy gondolják, hogy ez az arcdiszmorfizmusok, a növekedés késleltetése és az értelmi fogyatékosság fő génje, de nem egyedülálló génje. Itt egy fiúról számolunk be de novo változatban NSD2 atipikus WHS klinikai megnyilvánulásokkal tovább támogatta a csonkoló variáns patogenezisét NSD2 és egyetlen génen körvonalazta az ezen variánsok okozta lehetséges tünetspektrumot.

Eset bemutatása

A tanulmány etikai jóváhagyását a Sanghaji Jiaotong Egyetem Orvostudományi Karának Sanghaj Gyermekorvosi Központjának etikai bizottsága kapta. Írásbeli tájékoztatáson alapuló beleegyezési engedélyt kaptak a nyomozást a proband szülei.

A teljes exom rögzítését az Agilent SureSelect V6 dúsító befogó készlettel (Agilent Technologies, Inc., Woburn, MA, USA) végeztük a gyártó utasításainak megfelelően. Az elfogott könyvtárat ezután egy Illumina HiSeq 2500 rendszeren (Illumina, Inc., San Diego, Kalifornia, USA) szekvenáltuk. A nyers szekvenálási adatokat a korábban leírt módon dolgoztuk fel [10]. Az összes észlelt változatot a TGex (Translational Genomics Expert) platformon elemeztük, a VarElect pontozási rendszerrel [11]. Az NSD2-n egy c.4029_4030insAAAA beépítési változatot, amely frame-shift mutációhoz vezet (p.Glu1344Lysfs * 49), észlelték, és feltételezhető, hogy nagy valószínűséggel mutáns mutáció.

A primerek a NSD2 gént (NM_ 133 330,2) az UCSC Exon Primer online szoftver (http://genome.ucsc.edu/index.html) felhasználásával terveztük és szintetizáltuk. A megerősítendő csonkító variáns primer szekvenciái a következők voltak: 5'-agtttgtctgcccgtcctgt-3 'és fordított 5'-TGAGGATGGCTCAGTGGTG-3'.

A céltöredékeket a betegek, valamint szülei amplifikálták polimeráz láncreakcióval (Takara Biotechnology, Co., Ltd., Dalian, Kína). A PCR-termékeket ABI3730XL szekvenszerrel (Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA, USA) szekvenáltuk a forward és a reverse primerekkel. A szekvenciaadatokat a Mutation Surveyor® szoftver 4.0.4 verziójával (SoftGenetics, LLC) elemeztük. A csonkító variánst de novo változatokként igazolták a probandumban.

Megbeszélés és következtetés

Összegzésként azonosítottunk egy de novo csonkító változatot NSD2 A WHS enyhe fenotípusos spektrumával rendelkező beteg génje tovább támogatta a null variánsok patogenezisét NSD2 szindrómás értelmi fogyatékosságban és fejlődési késésben, és ezek a változatok a WHS enyhe formájához vezetnek.

Az adatok és anyagok rendelkezésre állása

A jelenlegi vizsgálat során felhasznált és/vagy elemzett adatkészletek (teljes exome szekvenálás és Sanger szekvenálás fájlok) a megfelelő szerzőtől ésszerű kérésre rendelkezésre állnak.