Intakt makromolekuláris egységek nagy érzékenységű Orbitrap tömegelemzése

Tárgyak

Absztrakt

A natív jellegű állapotokban lévő ép fehérjegyüttesek tömegspektrometriás elemzése rengeteg információt nyújt biokémiai és biofizikai tulajdonságaikról. Itt megmutatjuk, hogy az Orbitrap tömegelemzővel meg lehet mérni egy megadaltonhoz közelítő molekuláris tömegű fehérjegyütteseket érzékenységgel az egyes ionok detektálásáig. Kisebb instrumentális módosítások lehetővé tették a különféle fehérjegyüttesek mérését kiemelkedő tömegspektrális felbontással.

Hozzáférési lehetőségek

Feliratkozás a Naplóra

Teljes napló hozzáférést kap 1 évre

csak 4,60 € kiadásonként

Az árak nettó árak.
Az áfát később hozzáadják a pénztárhoz.

Cikk bérlés vagy vásárlás

Időben korlátozott vagy teljes cikkelérést kaphat a ReadCube-on.

Az árak nettó árak.

intakt

Hivatkozások

Sharon, M. és Robinson, C.V. Annu. Tiszteletes Biochem. 76, 167–193 (2007).

Heck, A.J. Nat. Mód 5., 927–933 (2008).

Cipész, G.K. et al. Mol. Sejt. Proteomika 9., 1742–1751 (2010).

Sobott, F., Hernandez, H., McCammon, M. G., Tito, M. A. és Robinson, C. V. Anális. Chem. 74., 1402–1407 (2002).

van den Heuvel, R. H. és munkatársai. Anális. Chem. 78, 7473–7483 (2006).

Krisztus, P. és mtsai. Eur. J. Mass Spectrom. (Chichester, Eng.) 10., 469–476 (2004).

Csernushevics, I.V. & Thomson, B.A. Anális. Chem. 76, 1754–1760 (2004).

Zhang, Z., Pan, H. és Chen, X. Tömegspektrum. Fordulat. 28., 147–176 (2009).

Perry, R. H., szakácsok, R. G. & Noll, R.J. Tömegspektrum. Fordulat. 27., 661–699 (2008).

Hendrix, R. W. és Johnson, J. E. Adv. Exp. Med. Biol. 726, 351–363 (2012).

Bochtler, M., Ditzel, L., Groll, M., Hartmann, C. és Huber, R. Annu. Tiszteletes Biophys. Biomol. Szerkezet. 28., 295–317 (1999).

Krishna, K. A., Rao, G. V. & Rao, K.R. Curr. Protein Pept. Sci. 8., 418–425 (2007).

Rostom, A.A. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 5185–5190 (2000).

Tito, M.A., Tars, K., Valegard, K., Hadju, J. & Robinson, C.V. J. Am. Chem. Soc. 122, 3550–3551 (2000).

Makarov, A. és Deniszov, E. J. Am. Soc. Tömegspektrum. 20, 1486–1495 (2009).

Benesch, J. L., Aquilina, J. A., Ruotolo, B. T., Sobott, F. és Robinson, C. V. Chem. Biol. 13., 597–605 (2006).

Monti, M.C. et al. Nukleinsavak Res. 39, 8052–8064 (2011).

Rogniaux, H. és mtsai. Anális. Biochem. 291, 48–61 (2001).

Zhou, M. és mtsai. Tudomány 334, 380–385 (2011).

Cui, W., Rohrs, H.W. & Gross, M.L. Elemző (Lond.) 136, 3854–3864 (2011).

Quaite-Randall, E. és Joachimiak, A. Módszerek Mol. Biol. 140, 29–39 (2000).

Olsen, J. V. és mtsai. Mol. Sejt. Proteomika 8., 2759–2769 (2009).

Michalski, A. és mtsai. Mol. Sejt. Proteomika 10., M111.011015 (2011).

Makarov, A. Anális. Chem. 72, 1156–1162 (2000).

Köszönetnyilvánítás

Ezt a munkát részben a PRIME-XS projekt támogatta, a 262067 számú támogatási szerződés, mind pedig a PROSPECTS hálózat (HEALTH-F4-2008-201648 támogatás), amelyeket az Európai Unió hetedik keretprogramja finanszírozott. A Holland Genetikai Kezdeményezésbe ágyazott Holland Proteomikai Központ támogatást nyert el. A szerzők köszönetet mondanak Michael Gröllnek (Technische Universitat Munchen) a 20S proteaszóma minta kedves adományáért, Jack Johnsonnak (Scripps Research Institute) a HK97 kapszomer mintáért, Genmabnak az IgG antitestért és Uwe Rickensnek (Thermo Fisher Scientific) az IonDetectionConverter fejlesztéséért. szoftver az egyionos kísérletekhez.

Szerzői információk

Hovatartozások

Biomolekuláris tömegspektrometria és proteomika, Bijvoet Biomolekuláris Kutatóközpont és Utrechti Gyógyszerésztudományi Intézet, Utrechti Egyetem, Utrecht, Hollandia

Rebecca J Rose és Albert J R Heck

Holland Proteomikai Központ, Utrecht, Hollandia

Rebecca J Rose és Albert J R Heck

Thermo Fisher Scientific (Bréma), Bréma, Németország

Eugen Damoc, Eduard Denisov és Alexander Makarov

A PubMed Google Scholar alkalmazásban is kereshet erre a szerzőre

A PubMed Google Scholar alkalmazásban is kereshet erre a szerzőre

A PubMed Google Scholar alkalmazásban is kereshet erre a szerzőre

A PubMed Google Scholar alkalmazásban is kereshet erre a szerzőre

A PubMed Google Scholar alkalmazásban is kereshet erre a szerzőre

Hozzájárulások

R.J.R., E.Da., E.De., A.M. és A.J.R.H. elvégezte a kísérleteket és megírta a kéziratot. A.M. felügyelte az Orbitrap tömegelemző módosításait. A.M. és A.J.R.H. koncepcionálisan megtervezte a művet.

Levelezési cím

Etikai nyilatkozatok

Versenyző érdekek

E.Da., E.De. és A.M. a Thermo Fisher Scientific munkatársai, az ebben a kutatásban használt Exactive Plus eszköz gyártója.

Kiegészítő információk

Kiegészítő szöveg és ábrák

1–10. Kiegészítő ábra (PDF 950 kb)

Jogok és engedélyek

Erről a cikkről

Idézd ezt a cikket

Rose, R., Damoc, E., Denisov, E. et al. Intakt makromolekuláris egységek nagy érzékenységű Orbitrap tömegelemzése. Nat Methods 9., 1084–1086 (2012). https://doi.org/10.1038/nmeth.2208

Beérkezett: 2012. június 20-án

Elfogadva: 2012. szeptember 17

Publikálva: 2012. október 14

Kibocsátás dátuma: 2012. november

További irodalom

A moduláris detergensek testre szabják a membránfehérjék tisztítását és szerkezeti elemzését, beleértve a G-fehérjéhez kapcsolt receptorokat is

  • Leonhard H. Urner
  • , Idlir Liko
  • , Hszin-Jung Jen
  • , Kin-Kuan Hoi
  • , Jani Reddy Bolla
  • , Joseph Gault
  • , Fernando Gonçalves Almeida
  • , Marc-Philip Schweder
  • , Denis Shutin
  • , Svenja Ehrmann
  • , Rainer Haag
  • , Carol V. Robinson
  • & Kevin Pagel

Nature Communications (2020)

A fehérje-alapú bioterápiás gyógyszerek LC – MS-alapú jellemzésének legújabb fejleményei - a növekvő formátum-komplexitás okozta analitikai kihívások elsajátítása

  • Tobias Graf
  • , Katrin Heinrich
  • , Ingrid Grunert
  • , Harald Wegele
  • , Markus Haberger
  • , Patrick Bulau
  • & Michael Leiss

Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis (2020)

Gént szállító vektorként használt Ikrek felületaktív anyagok metabolitjainak tömegspektrometriás detektálása és jellemzése

  • Wei Jin
  • , Randy Purves
  • , Ed Krol
  • , Badea Ildikó
  • & Anas El-Aneed

Az Amerikai Tömegspektrometriai Társaság folyóirata (2020)

Gyors online puffercsere fehérjék, fehérjekomplexek és sejtlizátumok szűrésére natív tömegspektrometriával

  • Zachary L. VanAernum
  • , Florian Busch
  • , Benjamin J. Jones
  • , Mengxuan Jia
  • , Zibo Chen
  • , Scott E. Boyken
  • , Aniruddha Sahasrabuddhe
  • , David Baker
  • & Vicki H. Wysocki

Természeti jegyzőkönyvek (2020)

Nagy tömeg analízis Fourier transzformációs ion-ciklotron rezonancia tömegspektrométerrel: szervetlen sócsoportoktól az antitestkonjugátumokig és azon túl

  • Iain D. G. Campuzano
  • , Michael Nshanian
  • , Christopher Spahr
  • , Carter Lantz
  • , Chawita Netirojjanakul
  • , Huilin Li
  • , Piriya Wongkongkathep
  • , Jeremy J. Wolff
  • & Joseph A. Loo

Az Amerikai Tömegspektrometriai Társaság folyóirata (2020)