Mikrobioma válaszok egy kontrollálatlan rövid távú diétás beavatkozásra a Citizen Science Project keretében

A mikrobiális taxonok társulása a hosszú távú táplálkozási szokásokkal és a kérdőív egyéb tényezőivel (n = 207 alany). A kiindulási minták elemzését taxonómiai szinten végeztem, fajonként phyláig. A sorok betűrendbe vannak rendezve. A sejt színe a MaAsLin elemzésből származó lineáris modell együttható értékét jelöli. Minden jelentős egyesület (FDR-korrigált p. 41], „#” - Wu et al., 2011 [13], „@” - újszerű társulások.

Jelentős változások az önkéntesek bél közösségi struktúrájában az étrendi ajánlások betartása után. A cladogram vörös ágai a taxonokat jelzik, amelyek bőségesen megnőttek, míg a kékek csökkentek. Jelentőségi kritérium: p 2 az LEfSe módszerben (n = 430 páros minta).

A bél mikrobiota reakciójának változása az étrendi beavatkozás során (n = 215 alany). A taxonómiai különbségek megoszlása ​​a metagenómák között a beavatkozás előtt és után az egyes alanyok számára (általánosított UniFrac mutató) különböző módon színeződik. Az (A) panelen a szín a válaszadókat (kék) és a nem válaszolókat (zöld) jelöli. A (B) és (C) paneleken a szín az átlagos Bacteroidetes: Firmicutes arányt jelöli a diéta előtt, ill. Rövidítések: B: F arány— Bacteroidetes: Firmicutes arány, N - nem válaszolók, R - válaszolók.

Klaszterelemzés mikrobiális nemzetségekre és mintákra. (A) Mikrobiális nemzetségek szövetkezetei. A csúcsok mérete arányos a nemzetségek átlagos relatív bőségével az összes metagenómában. A „_u” Postfix az adott család összes osztályozatlan nemzetségét jelöli. (B) Kapcsolatok a szövetkezetek és a permatípusok között (fő koordináta-elemzés [PCoA] általánosított UniFrac metrika segítségével). (C) Változások a résztvevők megoszlásában a permatípusok között az étrendi ajánlások betartása után.

A bél mikrobiota lendülete a rövid távú étrend hatása után. A javasolt hatást leíró diagramban a körök a tipikus válaszadók (R) és a nem reagálók (N) diétája előtt és után jelzik a közösségi struktúrák helyét a diéta előtt és után a lehetséges mikrobiota konfigurációk sematikus táján. A nyilak a mikrobiota változását jelzik az étrend hatása alatt.

Absztrakt

szövegű

A mikrobiális taxonok társulása a hosszú távú táplálkozási szokásokkal és a kérdőív egyéb tényezőivel (n = 207 alany). A kiindulási minták elemzését taxonómiai szinten végeztem, fajonként phyláig. A sorok betűrendbe vannak rendezve. A sejt színe a MaAsLin elemzésből származó lineáris modell együttható értékét jelöli. Minden jelentős egyesület (FDR-korrigált p. 41], „#” - Wu et al., 2011 [13], „@” - újszerű társulások.

Jelentős változások az önkéntesek bél közösségi struktúrájában az étrendi ajánlások betartása után. A cladogram vörös ágai a taxonokat jelzik, amelyek bőségesen megnőttek, míg a kékek csökkentek. Jelentőségi kritérium: p 2 LEfSe módszerben (n = 430 páros minta).

A bél mikrobiota reakciójának változása az étrendi beavatkozás során (n = 215 alany). A taxonómiai különbségek megoszlása ​​a metagenómák között a beavatkozás előtt és után az egyes alanyok számára (általánosított UniFrac mutató) különböző módon színeződik. Az (A) panelen a szín a válaszadókat (kék) és a nem válaszolókat (zöld) jelöli. A (B) és (C) paneleken a szín az átlagos Bacteroidetes: Firmicutes arányt jelöli a diéta előtt, ill. Rövidítések: B: F arány— Bacteroidetes: Firmicutes arány, N - nem válaszolók, R - válaszolók.

Klaszterelemzés mikrobiális nemzetségekre és mintákra. (A) Mikrobiális nemzetségek szövetkezetei. A csúcsok mérete arányos a nemzetségek átlagos relatív bőségével az összes metagenómában. A „_u” Postfix az adott család összes osztályozatlan nemzetségét jelöli. (B) Kapcsolatok a szövetkezetek és a permatípusok között (fő koordináta-elemzés [PCoA] általánosított UniFrac metrika segítségével). (C) A résztvevők permatípusok közötti megoszlásának változásai az étrendi ajánlások betartása után.

A bél mikrobiota lendülete a rövid távú étrend hatása után. A javasolt hatást leíró diagramban a körök a tipikus válaszadók (R) és a nem reagálók (N) diétája előtt és után jelzik a közösségi struktúrák helyét a diéta előtt és után a lehetséges mikrobiota konfigurációk sematikus táján. A nyilak a mikrobiota változását jelzik az étrend hatása alatt.