A genetikai, transzkripciós és biológiai információk integrálása betekintést nyújt az elhízásba

Tárgyak

Absztrakt

Célkitűzés

A testzsír-eloszlás mutatói örökölhetőek, de kevés genetikai jelet jelentettek a testzsír-eloszlás számítógépes tomográfia (CT) képalkotó méréseinek genomszintű társulási tanulmányaiból (GWAS). Célul tűztük ki az adipozitási tulajdonságokkal összefüggő gének és a kulcsfontosságú mozgatórugók azonosítását, amelyek központi szerepet játszanak a zsíros szabályozó hálózatokban.

biológiai

Tárgyak

Elemeztük a nagy közösségi alapú kohorsz, a Framingham Heart Study résztvevőinek vérében lévő génátiratok expressziójának adatait (n 4303-ig), valamint elvégezte ezen adatok és a meglévő biológiai információk integratív elemzését.

Eredmények

Egyesületünk egyedi és gyakori génexpressziós aláírásokat elemez számos adipozitási vonáson keresztül, beleértve a testtömeg-indexet, a derék-csípő arányt, a derék kerületét és a CT által mért indexeket, beleértve a zsigeri és a szubkután zsírszövetek mennyiségét és minőségét. Hat dúsított KEGG utat és két ko-expressziós modult azonosítottunk a zsírszabályozó hálózatok további feltárásához. Az integratív elemzés négy génkészletet mutatott ki (Apoptózis, p53 jelátviteli út, Proteasome, Ubiquitin által közvetített proteolízis) és két ko-expressziós modult, jelentős genetikai variánsokkal és 94 kulcsfontosságú hajtóval/génnel, amelyek helyi hálózatai adipozitással kapcsolatos génekkel voltak gazdagabbak, ami arra utal, hogy ezek a dúsított utak vagy modulok genetikai hatással vannak az adipozitásra. A legtöbb azonosított kulcsfontosságú mozgató gén olyan esszenciális biológiai folyamatokban vesz részt, mint a sejtciklus szabályozása, a DNS-helyreállítás és a szabályozó fehérjék lebontása rákkal kapcsolatos.

Következtetések

A genetikai, transzkripciós és biológiai információk integratív elemzése felsorolja a kényszerítő jelölteket a további nyomon követési funkcionális vizsgálatok számára az elhízás hátterében álló biológiai mechanizmusok feltárására. Ezek a jelöltek kiemelik a CT-eredetű és a központi adipozitási tulajdonságok vizsgálatának értékét.