A streptozotocin által kiváltott diabetes mellitus által szabályozott mPTP fehérjék hatékonyan részt vesznek a szívizom anyagcsere-adaptációjának fenntartásában.
A mitokondriális permeabilitás átmeneti pórusainak (mPTP) felépítésében és szabályozásában részt vevő fehérjék közötti kölcsönös fehérje kölcsönhatások (a STRING szoftver hozta létre) [36]. Minimális szükséges interakciós pontszám: nagy magabiztosság (0,700). A vonalvastagság jelzi az adattámogatás erősségét. A fehérje nevek rövidítései a STRING hálózat alatti jelmagyarázatban találhatók.
A fehérje D és C körülmények közötti mennyisége közötti különbség scatter diagramja a két mérés átlagához viszonyítva ábrázolható, mindkettő logaritmikus skálán. A vízszintes vonalakat az átlagos különbség és az egyezési határok között húzzuk meg (95% LoA: 0,0263–0,1725). Az átlag vonala egyértelműen +0,0994 abszolút szisztematikus különbséget mutat a vizsgált mPTP fehérjekomponenseknél (n = 18) a két körülmény között (páros t-teszt p -érték = 0,0106). A legkülönbözőbb mennyiségű fehérje az ATP5H volt, a különbség a D-csoport javára fordult elő; ez statisztikai szignifikanciát is elért (vö. 2. táblázat). A legmagasabb átlagos bőséggel bíró többi mPTP fehérje az ADT1, ATPA és ATPB volt. Az alacsony bőségű fehérjék, amelyeknél a relatív változás legnagyobb volt, mind a D-állapot mellett, mind az ATP5J és a KCRS voltak. A log skála additív hatásait az eredeti skálán multiplikatív hatásokká alakítottuk át. A fekete vonallal jelölt nulla érték megfelel az ekvivalencia vonalnak (vö. 3. ábra).
18 fehérje differenciál expressziós profilja mindkét állapotban (D és C) közös a szív mitokondrium proteomáiban. Csak azokat a fehérjéket tekintettük biológiailag szignifikáns változásnak, amelyek relatív D-tartalmában C-érték legalább 1,5-szeresére változott (piros vonal), vagy -1,5-gyel, ha 1/FC = C/D (kék vonal) kifejezték. A legelterjedtebb mPTP fehérjék, nevezetesen az ATPA, ATPB, ATD1 és ATP5H (pl. Bland – Altman diagram) hajtásváltozásai nem voltak szignifikánsak, kivéve az utóbbi fehérjét, amelyet az anyagcsere előkezelése után szignifikánsan felszabályoztak. A fehérje teljes szintjén 18 fehérje közül 15 felszabályozott fehérjét azonosítottak (83,3%, pontos Clopper-Pearson 95% -os konfidenciaintervallum = 58,6% - 96,4%) D-állapotban és 3-at (16,7%, 95% konfidenciaintervallum = 3,6 % -tól 41,4% -ig) azonosítottak C feltétel mellett. A binomiális teszt 0,0075 p-értéket eredményezett, ami statisztikailag szignifikáns összfelszabályozást jelölt a D feltétel alatt a kontrollokkal összehasonlítva. * p ≤ 0,05, ** p ≤ 0,01 a C-hez képest.
Spearman-féle korrelációs hőtérkép az összes azonosított fehérje-mennyiség között az egész mintában (4 A: felső hőtérkép) és kísérleti állapot szerint rétegezve (4 B: középső hőtérkép a cukorbetegséghez; 4 C: alsó hőtérkép a kontrollcsoport számára). A hőtérkép-rács egy pontjához rendelt szín jelzi a két fehérje-bőség közötti sajátos összefüggés erősségét. A korreláció mértékét a piros jelzi a negatív korrelációknál, a kék pedig a pozitív korrelációkat, amint azt a színkulcs mutatja. Statisztikailag szignifikáns összefüggéseket jelölünk meg a cellahatárok segítségével. Vegye figyelembe, hogy a korrelációs mátrix felső háromszög fele szimmetrikus az alsó háromszög felével. Így nincs szükség a teljes mátrix megjelenítésére.
- Az IJMS szekréciós fehérjék ingyenes teljes szöveges transzlációs ellenőrzése az egészség és a betegség HTML-jében
- IJERPH szabad, teljes szövegű, 2. típusú cukorbetegség a II. És III. Osztályú elhízás prevalenciában, társult
- Az IJMS szabad teljes szövegű eritropoietin-utánzó peptid (pHBSP) korrigálja az endothel diszfunkciót
- Az IJMS szabad teljes szövegű biodiverzitása és a bélgomba-közösségek aktivitása a
- A sovány és elhízott egerekből származó IJMS szabad, teljes szövegű zsírszövet mezenkimális hámréteget indukál