Átmeneti reakció közbenső termék megfigyelése megvilágítja az AAA-ATPáz p97 mechanokémiai ciklusát

Publikációs előzmények

Cikk nézetek
Altmetrikus
Idézetek

A cikknézetek a teljes szöveges cikkletöltések COUNTER-kompatibilis összege 2008 novembere óta (mind PDF, mind HTML) az összes intézményben és magánszemélyben. Ezeket a mutatókat rendszeresen frissítik, hogy tükrözzék az elmúlt napokig tartó felhasználást.

Az idézetek a cikkre hivatkozó egyéb cikkek száma, a Crossref által kiszámítva és naponta frissítve. További információ a Crossref hivatkozási számáról.

Az Altmetric Attention Score egy kvantitatív mértéke annak a figyelemnek, amelyet egy kutatási cikk online kapott. A fánk ikonra kattintva az altmetric.com oldal egy oldalt tölt be, amely további részleteket tartalmaz az adott cikk pontszámáról és a közösségi média jelenlétéről. További információ az Altmetric Attention Score-ról és a pontszám kiszámításáról.

termékének

Absztrakt

Az emberi ATPáz p97, más néven valozintartalmú fehérje vagy Cdc48, egy rendkívül bőséges AAA + motor, amely különböző energiafogyasztási folyamatokat táplál az emberi sejtben. A p97 a rákterápia lehetséges célpontja, és működési hibája degeneratív betegséget okoz. Itt valós időben figyelemmel kísérjük a p97 enzimatikus aktivitását NMR-alapú megközelítésen keresztül, amely lehetővé teszi számunkra, hogy kövessük azokat a lépéseket, amelyek az ATP-forgalmat összekapcsolják a mechanikai munkával. Adataink azonosítanak egy átmeneti reakcióközbensőt, a megfoghatatlan ADP.Pi nukleotid állapotot, amelyet sok ATPáz esetében feltételeztek, de eddig elkerülte a közvetlen detektálást. A p97-ben ez a faj döntő jelentőségű az adenozin-trifoszfát-forgalom szabályozásában az első nukleotidkötő doménben. Bemutatjuk továbbá, hogy az enzimatikus ciklust hogyan hatástalanítják a betegséggel összefüggő funkció-nyereség mutációk. A fehérje és a nukleotid konformációs átmeneteire vonatkozó nagy felbontású betekintés áthidalja a statikus enzimszerkezetek és a szubsztrátkonverzió dinamikája közötti szakadékot. Megközelítésünk az oldat- és a szilárdtest-NMR módszerek szoros integrációjára támaszkodik, és általában alkalmazható a nagy molekuláris motorok mechanokémiai működési módjainak megvilágítására.

segítő információ

A támogató információk ingyenesen elérhetők a https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.0c03180 címen.

Anyagok és módszerek a minta előkészítésének leírásával; NMR adatok gyűjtése és kiértékelése; kinetika és nukleotidkötés elemzése; Az S1 – S14. Ábra a nukleotidkötő zseb szemléltetésével, további NMR spektrumok, a nukleotidkötés szimulációi; és S1 – S5 táblázat táblázatos kémiai eltolódási zavarokkal, valamint kísérleti és illesztési paraméterekkel (PDF)