Biokomputációs elemzések és kísérleti validálás azonosítja a

Az RpaB egy komplex regulont irányít, messze túl a fotoszintetikus gépen

Az IsrR, PsrR1 és mások RNS-szabályozóinak expressziója az RpaB-től függ

Az RpaB keresztszabályokat mutat más transzkripciós faktorokkal, az NtcA és a Fur

Az RpaB kulcsfontosságú transzkripciós szabályozó egy fotoszintetikus mikroorganizmusban

Összegzés

Az oxigénes fotoszintézis megköveteli a környezeti ingerek összehangolását a transzkripció szabályozásával. Az RpaB transzkripciós faktor a legegyszerűbb egysejtű cianobaktériumoktól komplex eukarióta algákig konzerválódik, amelyek több mint 1 milliárd éves evolúciót képviselnek. A cyanobacterium Synechocystis RpaB által vezérelt regulonjának megjóslásához elemeztük a kötőhelyek helyzetbeli eloszlását, valamint a transzkripciós kezdőhelyek (TSS) nagy felbontású térképészeti adatait. Több mint 150 célpromotort írunk le, akiknek aktivitása reagál az ingadozó fényviszonyokra. A TSS-hez közeli kötőhelyek elnyomják az elnyomást, míg a ~ 50 nt felfelé irányított helyek aktiválást közvetítenek. Komplementer kísérleti megközelítések segítségével azt tapasztaltuk, hogy az RpaB szabályozza a fényvédelemben, a ciklikus elektronáramlásban és az állapotátmenetekben, a fotoreszpirációban, valamint a nirA és az isiA-ban részt vevő géneket, amelyek esetében keresztszabályozást javasolunk az NtcA vagy FurA transzkripciós faktorokkal. Az RpaB mély integrációja a különféle fotoszintetikus génfunkciókkal teszi az egyik legfontosabb és legsokoldalúbb transzkripciós szabályozóvá.

Grafikai absztrakt

Letöltés: Nagy felbontású kép letöltése (321 KB)
Letöltés: Teljes méretű kép letöltése

Előző kiadott cikk Következő kiadott cikk