Egy 45 000 éves modern ember genomszekvenciája Nyugat-Szibériából

Hovatartozások

1 1] A Kínai Tudományos Akadémia gerinces evolúciójának és emberi eredetének legfontosabb laboratóriuma, IVPP, CAS, Peking 100044, Kína [2] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Evolúciós Genetikai Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország.
2 1] Broad Institute of MIT és Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [2] Genetikai Tanszék, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA.
3 1] Broad Institute of MIT és Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [2] Biológiai Tudományok Tanszék, Columbia Egyetem, New York, New York 10027, USA.
4 Integratív Biológia Tanszék, Kaliforniai Egyetem, Berkeley, Kalifornia 94720-3140, USA.
5 Az Északi Fejlesztési Problémák Intézete, az Orosz Tudományos Akadémia szibériai ága, Tyumen 625026, Oroszország.
6 Szakértői kriminalisztikai központ, a Belügyminisztérium omszki osztálya, Omszk 644007, Oroszország.
7 Biológiai Tanszék, Emory Egyetem, Atlanta, Georgia 30322, USA.
8 Evolúciós genetika tanszék, Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, D-04103 Lipcse, Németország.
9 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, Emberi Evolúció Tanszék, D-04103 Lipcse, Németország [2] Antropológiai Tanszék, Kaliforniai Egyetem, Davis, Kalifornia 95616, USA.
10 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, Emberi Evolúció Tanszék, D-04103 Lipcse, Németország [2] Régészeti Tanszék, Fokváros Egyetem, Fokváros 7701, Dél-Afrika [3] Departament de Prehistòria i Arqueologia, Universitat de València, Valencia 46010, Spanyolország.
11 Földtani és Ásványtani Intézet, az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltsége, Novoszibirszk 630090, Oroszország.
12 Növény- és Állatökológiai Intézet, az Orosz Tudományos Akadémia Uráli részlege, Jekatyerinburg 620144, Oroszország.
13 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Emberi Evolúció Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország [2] Archeológiai Laboratórium, Antropológiai Tanszék, British Columbia Egyetem, Vancouver, British Columbia V6T 1Z1, Kanada.
14 Szibériai Kulturális Központ, Omszk 644010, Oroszország.
15 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Evolúciós Genetika Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország [2] Santa Fe Intézet, Santa Fe, Új-Mexikó 87501, USA.
16 Oxford Radiocarbon Accelerator Unit, Régészeti és Művészettörténeti Kutatólaboratórium, Oxfordi Egyetem, Oxford OX1 3QY, Egyesült Királyság.
17 Az emberi evolúció tanszéke, Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, D-04103 Lipcse, Németország.
18 1] Broad Institute of MIT és Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [2] Genetikai Tanszék, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA [3] Howard Hughes Medical Institute, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA.
19 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Evolúciós Genetika Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország [2] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Emberi Evolúció Tanszék, D-04103 Lipcse, Németország.

PMID: 25341783
PMCID: PMC4753769
DOI: 10.1038/természet13810

Ingyenes PMC cikk

Szerzői

Hovatartozások

1 1] A Kínai Tudományos Akadémia gerinces evolúciójának és emberi eredetének legfontosabb laboratóriuma, IVPP, CAS, Peking 100044, Kína [2] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Evolúciós Genetikai Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország.
2 1] Broad Institute of MIT és Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [2] Genetikai Tanszék, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA.
3 1] Broad Institute of MIT és Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [2] Biológiai Tudományok Tanszék, Columbia Egyetem, New York, New York 10027, USA.
4 Integratív Biológia Tanszék, Kaliforniai Egyetem, Berkeley, Kalifornia 94720-3140, USA.
5 Az Északi Fejlesztési Problémák Intézete, az Orosz Tudományos Akadémia szibériai ága, Tyumen 625026, Oroszország.
6 Szakértői kriminalisztikai központ, a Belügyminisztérium omszki osztálya, Omszk, 644007, Oroszország.
7 Biológiai Tanszék, Emory Egyetem, Atlanta, Georgia 30322, USA.
8 Evolúciós genetika tanszék, Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, D-04103 Lipcse, Németország.
9 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, Emberi Evolúció Tanszék, D-04103 Lipcse, Németország [2] Antropológiai Tanszék, Kaliforniai Egyetem, Davis, Kalifornia 95616, USA.
10 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, Emberi Evolúció Tanszék, D-04103 Lipcse, Németország [2] Régészeti Tanszék, Fokváros Egyetem, Fokváros 7701, Dél-Afrika [3] Departament de Prehistòria i Arqueologia, Universitat de València, Valencia 46010, Spanyolország [4] Növényi élelmiszerek kutatási csoportja a hominin étrendi ökológiában, Max-Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, D-04103 Lipcse, Németország.
11 Földtani és Ásványtani Intézet, az Orosz Tudományos Akadémia szibériai kirendeltsége, Novoszibirszk 630090, Oroszország.
12 Növény- és Állatökológiai Intézet, az Orosz Tudományos Akadémia Uráli Kirendeltsége, Jekatyerinburg 620144, Oroszország.
13 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Emberi Evolúció Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország [2] Archeológiai Laboratórium, Antropológiai Tanszék, British Columbia Egyetem, Vancouver, British Columbia V6T 1Z1, Kanada.
14 Szibériai Kulturális Központ, Omszk 644010, Oroszország.
15 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Evolúciós Genetika Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország [2] Santa Fe Intézet, Santa Fe, Új-Mexikó 87501, USA.
16 Oxford Radiocarbon Accelerator Unit, Régészeti és Művészettörténeti Kutatólaboratórium, Oxfordi Egyetem, Oxford OX1 3QY, Egyesült Királyság.
17 Az emberi evolúció tanszéke, Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet, D-04103 Lipcse, Németország.
18 1] Broad Institute of MIT és Harvard, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [2] Genetikai Tanszék, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA [3] Howard Hughes Medical Institute, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA.
19 1] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Evolúciós Genetika Tanszéke, D-04103 Lipcse, Németország [2] Max Planck Evolúciós Antropológiai Intézet Emberi Evolúció Tanszék, D-04103 Lipcse, Németország.

Absztrakt

Bemutatjuk egy körülbelül 45 000 éves, szibériai modern ember hímjének kiváló minőségű genomszekvenciáját. Ez az egyén olyan populációból származik, amely a népesség szétválasztása előtt vagy azzal egyidejűleg élt Eurázsia nyugati és keleti részén, és hasonló mennyiségű neandervölgyi származást hordoz, mint a mai eurázsiak. A neandervölgyi ősök genomi szegmensei azonban lényegesen hosszabbak, mint a mai egyéneknél megfigyeltek, ami azt jelzi, hogy a neandervölgyi génáramlás ennek az egyénnek az őseibe 7000-13 000 évvel azelőtt történt, hogy élt volna. Becslések szerint az autoszomális mutáció gyakorisága 0,4 × 10 (-9) - 0,6 × 10 (-9) per év, az Y kromoszóma mutációs rátája helyenként 0,7 × 10 (-9) - 0,9 × 10 (-9) évente, a mai nem afrikaiaknál bekövetkezett további szubsztitúciók alapján, összehasonlítva ezzel a genommal, és a mitokondriális mutáció mértéke 1,8 × 10 (-8) - 3,2 × 10 (-8) helyenként évente, a a csont kora.

Összeférhetetlenségi nyilatkozat

A szerzők kijelentik, hogy nincsenek versengő pénzügyi érdekeik.

Ábrák

a) Szibéria térképe…

a) Szibéria térképe a főbb régészeti lelőhelyekkel. Háromszögek: neandertali kövületek; fehér kör…

A) Főkomponensek (PC) elemzése…

A) A fő alkotóelemek (PC) elemzése 922 mai egyén felhasználásával 53 populációból és…

Statisztikák tesztelik, hogy az Ust’-Ishim…

Statisztikák azt tesztelik, hogy az Ust’-Ishim genom osztottabb alléleket oszt-e meg egy vagy több

A következtetett populációnagyság változása…

A következtetett populációméret az idők folyamán változik. Az „idő” az X tengelyen…

A neandertali származás régiói…

A neandertali származás régiói a 12. kromoszómán az Ust’-Ishim egyénben és tizenöt…

Exponenciálisan illesztett görbék mutatják a…

Exponenciálisan illesztett görbék, amelyek a páronkénti kovariancia csökkenését mutatják változó pozíciók esetén, ahol…