Élelmiszerallergiás gyermekek bél dysbiosisának előzetes vizsgálata

Élelmiszer- és táplálkozástudomány (megjegyzés)

Teljes cikk
Ábrák és adatok
Hivatkozások
Idézetek
Metrikák
Újranyomtatások és engedélyek
PDF

Absztrakt

Az ételallergiás gyermekek bél mikrobiotáját nagy áteresztőképességű 16S rRNS génszekvenálással elemeztük. Ételallergiás gyermekeknél a bél dysbiosis jeleit figyelték meg, amely valószínűleg bélgyulladással jár. Például a nemzetség csökkenése Akkermansia de megnövekedett bősége Veillonella ételallergiás gyermekeknél találták az egészséges kontroll gyermekeknél.

Az atópiás betegségek és az ételallergiák magas gyakorisága továbbra is megfigyelhető 5 éves korban. 12) A fent említett öt kísérlet hátralévő vizsgálatában használt gyermekek életkora 2–8 év volt. 9) Tehát úgy gondoljuk, hogy kísérleti protokollját érdemes értékelni, de csak bizonyos paraméterek beállítása után. Például a szóban forgó vizsgálat a 27f-et használta primerként, amelyről ismert, hogy alkalmatlan az amplifikálásra Bifidobaktériumok a sorrendben elmaradt mérkőzések miatt. 13) Ráadásul a vizsgálatban alkalmazott piroszekvenálási módszer kevésbé pontos, mint a széles körben alkalmazott Sanger-szekvenálási módszer. 14)

Ebben a tanulmányban a béldiszbiózis és az ételallergiák esetleges kapcsolatának felmérésére 18 hónapos és 6 év közötti gyermekeket vettek fel, akik allergiásnak bizonyultak az élelmiszerekre. Bélmikrobiotájukat kevésbé elfogult 341F és 805R univerzális primerekkel elemeztük 16S rRNS génhez és MiSeq platformot analitikai módszerként, amely Sanger szekvenálási módszeren alapult.

A vizsgálat kísérleti protokollját a Shiga Orvostudományi Egyetem etikai bizottsága hagyta jóvá (jóváhagyási szám: 23-104). Tájékozott beleegyezést kaptak mind a nyolc csecsemő szülei, akiknek a mintáit ebben a vizsgálatban használták. Négy gyermeket, akiket súlyos allergiás betegség érint, és amelyeket klinikai tünetek alapján diagnosztizáltak, és szérumallergén-specifikus IgE tesztet alkalmaztak, ebbe a vizsgálatba vették be. Ezen kívül négy egészséges gyermek a hasonló az allergiás gyermekek életkorát használták kontrollként. Az összes csecsemő információit az 1. táblázat sorolja fel. Valamennyi gyermeket hüvelyi úton, teljes időtartamban (> 37. terhességi hét) szültek és kevertetettek, egy kontroll gyermek kivételével, akit szoptattak. A mintavétel előtt legalább egy hónapig egyetlen csecsemőnél sem alkalmaztak antibiotikus kezelést.

Online közzététel:

1. táblázat: Ebben a vizsgálatban nyolc alany klinikai adatai.

A frissen kiürített ürüléket aszeptikusan sterilizált tartályokba gyűjtötték (széklet hordozó: atect, Osaka, Japán), és a gyűjtés alatt -20 ° C-on tartották. Ezután az ürítést követő 24 órán belül a székletmintákat laboratóriumunkba szállítottuk, és további felhasználásig -80 ° C-on tároltuk.

MiSeq TM rendszerrel (Illumina, San Diego, Kalifornia) végzett 16S rRNS szekvenálást egy korábban leírt módszer szerint hajtottuk végre. 15) A 16S rRNS V3-V4 régiójának PCR-amplifikációját 314F és 805R primerek alkalmazásával hajtottuk végre. A szekvenálási adatok feldolgozását, beleértve a minőségi szűrést, a kiméra ellenőrzést, az OTU definíciót és a taxonómia hozzárendelést, a QIIME, 16) USEARCH, 17) és az UCHIME 18) alkalmazásával hajtottuk végre, pontosan az előzőekben leírtak szerint. 15) Statisztikai különbség (o 19) A baktérium nemzetség gyakoriságát statisztikailag elemeztük Pearson khi-négyzet tesztjével R szoftver segítségével (3.3.2. Verzió; https://www.r-project.org/).

Az adatfeldolgozás során összesen 205 055 kiváló minőségű szekvenciát (átlag: 25 632 olvasás) kaptunk, és 205 OTU-t definiáltunk (szingletet eltávolítottunk). A súlyozott UniFrac távolság fő komponens elemzése az ételallergiás és egészséges gyermekek közötti bél mikrobiotában mutatott különbségeket (PC2: o Élelmiszerallergiás gyermekek bél dysbiosisának előzetes vizsgálata

Online közzététel:

1. ábra: A bél mikrobiota súlyozott UniFrac távolságának elemzése az ételallergiás és egészséges gyermekeknél.

Megjegyzések: A folytonos háromszögek az ételallergiás gyermekek adatait jelzik. Szilárd körök mutatják az egészséges gyermekek adatait.

Online közzététel:

2. táblázat: Egészséges és ételallergiás gyermekek bél mikrobiotájának összetétele.

Az ételallergiás gyermekek bél dysbiosisát, különösen az elválasztás után, ritkán vizsgálták. Jelen tanulmányban kísérletet végeztünk az ételallergiás gyermekek bél dysbiosisának előzetes értékelésére egy nagyobb léptékű vizsgálat előtt. Bár ebben a vizsgálatban az alanyok száma viszonylag kicsi volt, érdekes adatokat szolgáltatott a bél mikrobiota tulajdonságairól az ételallergiás gyermekeknél.

Jelen munkánkban bebizonyítottuk, hogy a bél dysbiosis, amely valószínűleg bélgyulladással jár, ételallergiás gyermekeknél fordul elő. Eredményeink alapján azt javasoljuk, hogy nagyobb mintanagyság mellett érdemes további vizsgálatokat végezni, amelyek az ételallergiás alanyok béldiszbiózára és annak bélgyulladással való kapcsolatára összpontosítanak.

Szerző hozzájárulás

R.I., C.S., T.S. és T. T. tervezett kutatásokat, T.S., C.S. és K.N. klinikai mintákat gyűjtöttek, R.I., M.N. és T. T. elvégezték a kísérleteket, R.I. és M.O. elemzett adatokat, valamint R.I. és G.A.R. írta a kéziratot. Minden szerző elolvasta és jóváhagyta a végleges kéziratot.

Közzétételi nyilatkozat

Potenciális összeférhetetlenségről a szerzők nem számoltak be.

Finanszírozás

Ezt a munkát a Morinaga Egészségügyi és Táplálkozási Alapítvány, valamint a SUMS elnök fiatal kutatók ösztönzésére nyújtott támogatása támogatta.