A metaanalízis reprodukálható bélmikrobioma-változásokat tár fel a zsírtartalmú étrendre adott válaszként -

A mikrobiom-adatkészletek metaanalíziséhez általánosítható megközelítést mutatunk be

A magas zsírtartalmú étrend reprodukálható elmozdulásokat indukál az egér bél mikrobiomjában

Az életképtelen Lactococcus szennyeződés elterjedt a kísérleti étrendben

A filogenetikai és génaláírások emberi mikrobiómákká alakulnak át

Összegzés

Több kutatócsoport kimutatta, hogy az étrend hatással van a bél mikrobiomjára; a kísérleti tervezés és a kvantitatív értékelés változékonysága azonban kihívást jelentett annak felmérésére, hogy a hasonló étrendeknek milyen mértékben vannak reprodukálható hatásai a vizsgálatok során. Elfogulatlan szubjektumszintű meta-analízis keretrendszer segítségével 27 étrendi vizsgálatot elemeztünk újra, beleértve 1101 rágcsálótól és embertől származó mintát. Bemutatjuk, hogy a magas zsírtartalmú étrend (HFD) reprodukálhatóan megváltoztatja a bél mikrobiális közösségének szerkezetét. A finomabb taxonómiai elemzésből kiderült, hogy a HFD legjobban reprodukálható jelei a Lactococcus fajok, amelyek kísérleti úton bizonyítottan általános étrendi szennyeződések. Ezenkívül a gépi tanulás megközelítése meghatározta az aláírást, amely megjósolja az egerek étrendi bevitelét, és bebizonyította, hogy ennek a modellnek a filogenetikai és géncentrikus transzformációi lefordíthatók az emberek számára. Ezek az eredmények együtt bizonyítják a mikrobiómák metaanalízisének hasznát a robusztus és reprodukálható tulajdonságok azonosításában a preklinikai modellekben végzett mechanisztikus vizsgálatokhoz.

Grafikai absztrakt

Letöltés: Nagy felbontású kép letöltése (237 KB)
Letöltés: Teljes méretű kép letöltése

Előző kiadott cikk Következő kiadott cikk