Dr. Emma Allen-Vercoe

Profil
Oktatás
Kutatás
Kutatási finanszírozási források
Tagságok
Válogatott kiadványok
Hozzáférés a kultúragyűjteményhez
Labor tagok
Egyetemi hallgatók
Öregdiákok
Hírek
Végzős hallgatók

Kutatói karrieremet egyetemi és posztgraduális tanulmányokkal kezdtem a Központi Állatorvosi Laboratóriumokban (ma Állatorvosi Laboratóriumok Ügynöksége) és az Alkalmazott és Mikrobiológiai Kutatások Központjában (CAMR, jelenleg Egészségvédelmi Ügynökség), Nagy-Britanniában, Martin Woodward professzor irányításával. Itt tanulmányoztam a enterális kórokozót, a Salmonella enterica Enterovidis szerovarust, és megalapozottan értékeltem azt a sok akadályt, amelyet egy bélben szenvedő kórokozónak a bélben kell leküzdenie ahhoz, hogy betegséget okozzon. Lenyűgözött az óriási virulencia faktorok arzenálja, amelyet az enterális kórokozók megkövetelnek a túlélés és a szaporodás érdekében a bélkörnyezetben.

Rövid posztdoktori időszakot töltöttem a CAMR-ben, megtanultam technikailag kihívást jelentő kórokozókkal, mint például a Mycobacterium tuberculosis és a Campylobacter jejuni dolgozni, mielőtt 2001-ben Kanadába költöztem volna, hogy posztdoktori posztot kezdjek a Calgaryi Egyetemen, dr. Közös irányításával. Rebekah DeVinney és Mike Surette. Itt dolgoztam az enteropatogén és az enterohemorrhagiás E. coli-n (EPEC és EHEC), sejt- és molekuláris biológiai technikákkal, hogy megvizsgáljam a III-as típusú szekréciós rendszereik lenyűgöző kölcsönhatásait a gazdasejtekkel.

Mindig is érdekelt, hogy többet megtudjak az emberi bélben lévő normális mikrobiális populációról, és 2004-ben elég szerencsés voltam ahhoz, hogy a Kanadai Gasztroenterológiai Szövetségen keresztül elnyerjem a Karok közötti átmenet díját. Ez a díj lehetővé tette számomra egy független kutatási program kidolgozását, amelynek célja a normál emberi mikrobiota és annak az emberi egészségre és betegségekre gyakorolt hatásának tanulmányozása volt. Ezt a programot vittem magammal Guelphbe 2007 decemberében.

Amióta itt vagyok, nagyon tehetséges munkatársaimnak és hallgatóimnak köszönhetően világszínvonalú anaerob mikrobiológiai létesítményt építettem, és irányítottam mind az alapvető kutatási kérdések megválaszolására, mind pedig a transzlációs lehetőségek megteremtésére a tudomány klinikára juttatására. 2013-ban társalapítottam a NuBiyota céget, amelynek feladata a „Mikrobiális ökoszisztéma terápiák” kifejlesztése olyan rendellenességek kezelésére, amelyek kiváltó oka a bél mikrobiális dysbiosisa.

Mottóm: "A mikrobáim azt mondták, hogy csináljam"
Hobbim: Kertészkedés, olvasás, olvasás a kertészkedésről

B.Sc. (Hons) Biokémia, Londoni Egyetem
Ph.D. Molecular Biology, Open University, az Egyesült Királyság CAMR-jével együtt
Posztdoktori munkatárs, University of Calgary

A laboratóriumomban végzett kutatások a normális emberi bél mikrobiota vizsgálatára összpontosulnak, mind betegségben, mind egészségi állapotban. A kutatás lazán felosztható több olyan fő területre, amelyek a bél mikrobiális ökológiájának alapvető kérdéseire összpontosulnak:

MI OTT NÖVEK?

Az emberi bélben lévő mikrobiális világ, bár nem nélkülözi a belső „tényezőt”, lenyűgöző hely, hatalmas mennyiségű sokféleséggel teli, de mégis nagyon rosszul megértett. Míg a molekuláris aláírások kimutatták, hogy a bélben lévő mikrobiota közösség sok száz baktériumfajt tartalmazhat, e fajoknak csak kis százalékát értik a biológiájuk szempontjából. Az ismeretek hiánya ezen a területen abból ered, hogy az emberi bélben élő baktériumok többségének tenyésztéséhez szükséges feltételeket még nem ismerik jól. Laboratóriumomban új technikákat dolgozunk ki a bélből származó új baktériumfajok tenyésztésére és tanulmányozására annak érdekében, hogy jobban megértsük, miként járulhatnak hozzá ezek a fajok a mikrobiota közösség egészének figyelemre méltó homeosztázisához. Kutatási megközelítésünk középpontjában egy folyamatos tenyésztési rendszert dolgoztunk ki, hogy modellezzük a baktériumok közösségeit a disztális bélen belül, amely az emberi test legsűrűbben lakott része a mikrobák szempontjából. A Robogut névre keresztelt modellünk hozzájárul a laboratórium számos projektjéhez. Kattintson erre a linkre, hogy megtekinthesse a CBC Quirks and Quarks rádióműsorának legújabb művét. Kattintson erre a linkre, hogy a laboratórium tagjai részletesen elmagyarázzák a rendszert.

Széleskörű együttműködést élveztünk a Massachusetts-i Cambridge-i Broad Intézettel, amelynek során a Human Microbiome Project révén jelentős számú baktérium izolátumot kértünk genomszekvenálásra. Szorosan együttműködünk a projekt elemeivel, ideértve a HMP szekvenálási projektek mikrobiológiai szabványainak elkészítését.

HOGYAN VÁLASZOL A BÉLMIKROBIÓTA KÖRNYEZETÉRE?

Érdekel a bél mikrobiota metabolikus kibocsátása és az, hogy ez hogyan változik a környezeti ingerekre reagálva. Érdekel a bél mikrobiota reakciója a gyógyszerekre, az élelmiszer-adalékokra és a gazdasejtekre. Kidolgoztuk az NMR-t a mikrobiális ökoszisztémák puskás metabolomikájának eszközeként, hogy segítsünk megérteni a mikrobiota zavarára adott válaszreakciókat. Jelenleg ezt a megközelítést alkalmazzuk számos betegség, köztük az 1-es típusú cukorbetegség, a vastagbélrák és az IBD vizsgálatára.

Érdekel még a virobiome - a vírusos mikrobiome - szerepe a bél egészségében is. A vírusok jelentik az emberi bél mikrobiomjának legtöbb elemét, de az ökoszisztéma fejlődésében és dinamikájában betöltött szerepüket nem ismerjük jól. A Robogut rendszer tökéletes lehetőséget kínál számunkra, hogy tanulmányozzuk a viróm kölcsönhatását a bél mikrobiális ökoszisztéma sejtkomponenseivel.

A NORMÁL MIKROBIÓTA BAKTÉRIUMFajai hozzájárulhatnak az egészséghez/betegséghez?

Egészséges emberben a bélben folyamatosan változó környezet ellenére a rezidens mikrobiota nagyrészt homeosztatikus egyensúlyt tart fenn, amely egyedülálló a gazdaszervezet számára. Egyre egyértelműbb, hogy ha ez az egyensúly eltolódik, akkor a következmények a gazdára nézve nagyon károsak lehetnek. Laboratóriumom számos kulcsfontosságú betegséget vizsgál, amelyek összefüggenek a bél mikrobiotájával: vastagbélrák, 1-es típusú cukorbetegség és Clostridioides difficile fertőzés (CDI).

Erre a linkre kattintva letöltheti a munkát leíró Medical Post cikket.
Kattintson erre a linkre a CTV megtekintéséhez. Az a nemzeti cikk, amely leírja a RePOOPulate használatát súlyos beteg CDI-betegek kezelésére.

Colorectalis rák a rák egyik vezető formája a világon. 2011-ben a BC Cancer Agency-szel együttműködve laboratóriumunk segített bemutatni egy adott anaerob faj, a Fusobacterium nucleatum túlteljességét vastagbélrákos daganatokban. Ez a lenyűgöző megállapítás számos további, jelenleg folyó vizsgálat előtt nyitott kaput, amelyek megpróbálják jellemezni ennek a rejtélyes fajnak a betegségekben betöltött szerepét. Laboratóriumomban arra összpontosítunk, hogy megértsük, hogyan hat az F. nucleatum a gazdasejtekkel a betegség kialakulásában, és hogyan befolyásolják ezt a folyamatot olyan tényezők, mint a gazda étrendje, a meglévő mikrobiom és az antibiotikumok használata. Ezen felül reméljük, hogy a NuBiyota terápiás ökoszisztéma-megközelítése hasznos lehet a CRC kezelésében az F. nucleatum terhelések csökkentése révén.

1. típusú cukorbetegség (T1D) súlyos anyagcsere-betegség, ahol a szervezetnek nehézségei vannak a vércukorszint szabályozásában, mivel a hasnyálmirigy elégtelen mennyiségű inzulint termel. Egyre több bizonyíték áll rendelkezésre arról, hogy a bél mikrobiota fontos szerepet játszik a T1D kialakulásában. Különösen a bélben található egyes mikrobiális fajoknak való kitettség érzékeny egyénekben autoimmun választ válthat ki a hasnyálmirigy inzulintermelő sejtjeire. Laboratóriumunk Jayne Danska, a Beteg gyerekek laboratóriumával együttműködve próbálja megérteni, hogy a bélmikrobák hogyan és miként járulnak hozzá a cukorbetegséghez.

Milyen következményekkel jár a "hiányzó mikrobiota"?

Általánosan elfogadott tény, hogy a nyugati világban az embereket kevésbé változatos ökoszisztéma gyarmatosítja, mint a modern kényelem nélkül élő emberek, például a vadász-gyűjtögető törzs emberei. Szeretnénk megérteni, hogy mi különbözik a vadászó-gyűjtögető bélmikrobiomban a „hiányzó mikrobák” anyagcseréjét illetően e fajok tenyésztésével és tanulmányozásával, valamint egy nyugati mikrobiom kiegészítésével.

Az egér mikrobiomjának megértése