Microbiome Digest - Bik válogatásai

Az MD csapat napi tudományos összefoglalása a tudományos mikrobiómákról. Elisabeth Bik, mikrobiológiai és tudományos integritási tanácsadó alapította. Twitter: @microbiomdigest

Jó szerdát kívánok! Néhány napos inaktivitás után ezt az összefoglalót a mikrobiómák kutatásának különböző aspektusairól szóló számos áttekintéssel hozzuk össze. Néhány tanulmányt is mellékeltünk a mikrobiota és az antibiotikumokkal szembeni rezisztenciáról, a mikrobiotáról és az anyagcseréről, és így tovább.

Emberi és általános mikrobiom

Áttekintés: Mikrobiota és anyagcsere - Újdonságok 2018-ban - Alexis Bretin - American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism

Áttekintés: Eikozanoidok a GI traktusban - John L Wallace - British Journal of Pharmacology

Áttekintés: Az emberi bél mikrobiota az egészségügyben és az Alzheimer-kórban - Leszek Szablewski - Journal of Alzheimer's Disease

A széklet mikrobiota profilja atópiás asztmás felnőtt betegeknél - A.M. Okba - Az allergia és a klinikai immunológia európai évkönyvei

Röviden: Mikrobioma: A mikrobiota beültetésének alapelvei - Andrea Du Toit - Nature Reviews mikrobiológia

Fórum: A bél mikrobiotája és a Parkinson-kór hiányos H2-termelése - Sergej M.Ostojic - Az endokrinológia és az anyagcsere tendenciái

Áttekintés: Agyetápláló áramkörök a Roux-en-Y gyomor bypass után - Mohammed K.Hankir - Az endokrinológia és az anyagcsere tendenciái

Állati mikrobiom

Kórokozókutatás

Áttekintés: Pseudomonas syringae: mi kell ahhoz, hogy kórokozó legyen - Xiu-Fang Xin - Nature Reviews Microbiology

Élelmiszer mikrobióm

Víz mikrobioma

Extremofilek

Egyéb papírok

100+ riasztás ma érdekes cikkekkel minden kategóriában. Néhány kiemelt téma az FMT donorok, a vírus inzulinszerű peptidek kiválasztása és 2 cikk a duplikált ábrák kimutatásáról.

Általános mikrobiom
Áttekintés: A precíziós orvoslás mikrobioma: a továbbjutás. - Joseph F Petrosino - Genomorvoslás

A mikrobiomika állampolgári tudományának résztvevőinek motivációi: a British Gut Project adatai. - Lorenzo Del Savio - Genetika az orvostudományban: Az Amerikai Orvosi Genetikai Főiskola Hivatalos Lapja

Terhesség és korai élet
A genitourináris mikrobiom szerepe a gyermekek urológiájában: áttekintés. - Daniel Gerber - Jelenlegi urológiai jelentések

Több helyből álló emberi mikrobiom
Áttekintés: A Vagus ideg a mikrobiota-bél-agy tengely felületén. - Bruno Bonaz - Határok az idegtudományban

Emberi hüvelyi mikrobiom
A cervicovaginalis folyadék fehérjetartalma megváltozik a bakteriális vaginosis során. - Carolina Sanitá Tafner Ferreira - Journal of Lower Genital Tract Disease

Emberi szinte steril helyek
Mikrobiom-gazda kölcsönhatások a vérképző őssejt-transzplantátum befogadóiban. - Tessa Andermann - A vér- és a velőtranszplantáció biológiája: Az Amerikai Vér- és Csonttranszplantációs Társaság folyóirata

Áttekintés: Emberi bél mikrobiota és gyomor-bélrendszeri rák. - Changting Meng - Genomika, Proteomika és Bioinformatika

Áttekintés: A bél egészségének szabályozása elágazó láncú aminosavakkal. - Hua Zhou - Animal Science Journal = Nihon Chikusan Gakkaiho

Könyvfejezet: Termesz bélmikrobiom - Navodita Maurice - Fenntarthatóság a növény- és növényvédelemben

Strukturális változatosság az arbuscularis micorrhizális, az ektomikorrhiza és az endofita növény-gomba hálózatok között - Hirokazu Toju - bioRxiv

Épített környezet
A kutya bevezetése megváltoztatja az otthoni por mikrobiotáját. - Alexandra Sitarik - Beltéri levegő

Probiotikumok/prebiotikumok/antibiotikumok
Epe-só-hidrolázok a probiotikus törzsből - Thibault Allain - határok a mikrobiológiában

Fágok és vírusok
** A vírusszerű inzulinszerű peptidek aktiválják az emberi inzulin és az IGF-1 receptor jelátvitelt: Paradigmaváltás a gazda-mikroba kölcsönhatásokhoz. - Emrah Altindis - Az Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Tudományos Akadémiájának közleményei

Genomok
A Won-Hyong Chung - a farmakológia határai teljes genomszekvencia és genomikus jellemzése

Ezen a pénteken: Szép cikkcsoport olyan kórokozókra összpontosítva, mint a Salmonella és a C. difficile, számos tanulmány a talaj/gyökér mikrobiomáról és még sok más

Emberi mikrobiom

Áttekintés: A bőr mikrobiota és az emberi 3D bőrmodellek - Franziska Rademacher - Kísérleti bőrgyógyászat

Kiemelt kutatási eredmények: Kolorektális rák: A baktériumok biofilmjei és toxinjai tökéletes vihart váltanak ki a vastagbélrákban - Iain Dickson - Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology

Kiemelt kutatási eredmények: Metabolizmus: A vékonybél - a fruktóz anyagcseréjének új szereplője - Ivone Leong - Nature Reviews Endocrinology

Állati mikrobiom/állatkísérletek

Emberi kórokozók

Élelmiszer mikrobióm

Növényi és környezeti mikrobiomák

Mikrobák általában

Események és munkahelyek

Terhesség és korai élet

Emberi fül, orr és torok mikrobioma

Emberi orális mikrobiom

Emberi hüvelyi mikrobiom

Emberi bél mikrobiómája

Állatkísérletek

Állati mikrobiom

Víz és extremofil mikrobióm

Bioinformatika

Biotechnológia

Mikrobák a hírekben

Események és munkahelyek

BioData World West 2018 - március 13-14. - Hotel Kabuki, San Francisco, Kalifornia

Általános mikrobiom

[szerkesztőség] Az emberi mikrobiom rendszerbiológiája - BP Bernabé, L Cralle, JA Gilbert - Jelenlegi vélemény a biotechnológiában, 2018

Emberi reproduktív vagy vizeleti mikrobiom

Emberi légúti mikrobiom

Emberi bél mikrobiómája

Állati mikrobiom

Növényi, gyökér- és talajmikrobiom

Víz és extremofil mikrobióm

Élelmiszer mikrobiológia

Fágok és vírusok

Bioinformatika

Technikák

Mikrobák a hírekben

Ed nem mikrobiológiai válogatói (természetesen használhatja a saját nevét is!) (Klassz nem mikrobiológiai tudomány)

A mai összefoglalóban olvasható: az atomi erő mikroszkópia előnyeiről a szóbeli mikrobiota tanulmányozásában S. S. Salavadhi cikkében; az I. típusú cukorbetegség bélmikrobiomával való összefüggéséről J.A. Mullaney; a szteroidok hatásáról a bél mikrobiotájára M. J. Tetel áttekintésében, valamint arról, hogy a Synechococcus cyanobacteria képes-e dinamikusan megváltoztatni pigmenttartalmukat, hogy megfeleljen a környezeti fény színének, T. Grébert cikkében. Ez természetesen csak néhány a sok érdekes cikk közül ma. Élvezd!

Események és munkahelyek

Általános mikrobiom

Áttekintés: Új darab a mikrobiom puzzle-ban - Lindsay J. Pike - Nature Reviews Microbiology

Terhesség és korai élet

Több helyből álló emberi mikrobiom

Orális mikrobiom

Emberi bél mikrobiómája

Áttekintés: Szteroidok, stressz és a bél mikrobioma-agy tengelye - M. J. Tetel - Journal of Neuroendocrinology

Állatkísérletek

Állati mikrobiom

Növényi, gyökér- és talajmikrobiom

Víz és extremofil mikrobióm

Fágok és vírusok

Mikrobák a hírekben

Események és munkahelyek

Általános mikrobiom

Orrmikrobioma

Terhesség és korai élet

Emberi hüvelyi mikrobiom

Emberi bél mikrobiómája

Microbiota: Pathobiont békefenntartók - Kirsty Minton, Nature Reviews Immunology

Orális mikrobiom

Állatkísérletek

Mikrobiota erjesztett takarmányban és sertésbélben - Cheng Wang, alkalmazott mikrobiológia és biotechnológia

Állati mikrobiom

Növényi, gyökér- és talajmikrobiom

Víz és extremofil mikrobióm

Élelmiszer mikrobiológia

Probiotikumok/Prebiotikumok

Bioinformatika

Technikák

Jó néhány cikk riasztásokkal a mai és az előző napról. Élvezze sok érdekes cikket a mikroba/mikroba és a mikroba-gazda interakciókról!

Események és munkahelyek
Senior bioinformatikus - fogadó mikrobiota interakciók - Wellcome Trust Sanger Intézet

Tanszékelnök - Mikrobiológiai és Immunológiai Tanszék - Állatorvosi Főiskola Cornell Egyetem, Ithaca, New York

Több helyből álló emberi mikrobiom
A mintatípusok, a tenyésztés és a 16S differenciális hozzájárulása - Lone Heimann Larsen - Journal Of Clinical Microbiology

Emberi orális mikrobiom
Baktériumok mikroleadása a támaszték-implantátum határfelületén, in vitro vizsgálat. - Carlos Larrucea - Klinikai implantátum fogászat és kapcsolódó kutatások

Emberi hüvelyi mikrobiom
Áttekintés: Cervicovaginalis mikrobiota és a reproduktív egészség: Az egyszerűség erénye. - Melis N Anahtar - Cell Host & Microb

Áttekintés: Bél mikrobiotán alapuló terápiák irritábilis bél szindrómához. - Emily K Stern - Klinikai és transzlációs gasztroenterológia

Mikrobiális-mikrobiális/gazda kölcsönhatások
A ragadozás és a zavarok közötti kölcsönhatások alakítják a zsákmányközösségeket. - Canan Karakoç - Tudományos jelentések

Víz és extremofil mikrobióm
Mikrobiális közösségek összetétele és aktivitása egy alkáli, hipersalin, tó redox gradiensén mentén. - Christian F Edwardson - Határok a mikrobiológiában

Épített környezet
A folyékony társszubsztrátok megerősítik a szennyvíz mikrobiómáit - Justus Hardegen - bioRxiv

Probiotikumok/prebiotikumok/antibiotikumok
A takrolimusz-koncentráció/dózis arány szilárd szervátültetett betegeknél, akiket székletmikrobiota transzplantációval kezeltek visszatérő Clostridium difficile fertőzés miatt. - Michael H Woodworth - Transzplantált fertőző betegség: A Transzplantációs Társaság hivatalos lapja

Mikrobák a hírekben
Utazás a „poopy laborba” a gyógyszerfejlesztés érdekében - Eric Boodman - STAT News

Boldog Holdújév a kutya!

A mai összefoglaló számos újdonságot tartalmaz, és tartalmaz egy fő cikket is a széklet mikrobiota transzplantációjának nyomon követéséről, a bél mikrobiotáját formáló antibakteriális fehérjék áttekintéséről, valamint felhívást a bioinformatikai programozással foglalkozó közösségek felépítésére.

Állások

Általános mikrobiológia

Könyvfejezet: Agro-ipari lignocellulóz-hulladék: alternatíva a jövő bioenergetikájának feltárására - Nidhi V. Maheshwari - Bioüzemanyagok: Üvegházhatású gázok enyhítése és globális felmelegedés

Emberi bél mikrobiómája

Áttekintés: A 2017. évi ASPEN kutatóműhely közleménye - gyomor bypass: a bél szerepe - Ajay Kumar Jain et al. - Journal of Parenteral & Enteral Nutrition

* Antibakteriális fegyverek: Célzott pusztítás a mikrobiotában - Benoit Chassaing és Eric Cascales - A mikrobiológia tendenciái

Perspektíva: Hogyan képezzük mikrobiomját brokkoli fogyasztására - Sam H. Au - Science Translational Medicine

Állatkísérletek

Állati mikrobiom

Növényi, gyökér- és talajmikrobiom

Víz és extremofil mikrobióm

Élelmiszer mikrobiológia

Fágok és vírusok

Könyvfejezet: Kullancs által okozott vírusok és a gazdabőr felülete - Mária Kazimírová et al. - Bőr- és ízeltlábú vektorok

Technológia

Mikrobák a hírekben

Mikrobák a piacon

Tudományos kommunikáció és oktatás

Különösen érdekes cikk a mesterséges baktériumokról a vastagbélrák kezelésében: Chun Loong Ho és munkatársai egy E. coli törzset készítettek a vastagbélrák sejtjeihez való kötődéshez, és konstitutív módon szekretálnak egy enzimet, amely az étrendből származó (keresztesvirágú zöldségekből származó) glükozinolátokat rákká alakíthatja. harci izotiocinátok. A rákkeltő anyagoknak kitett és mind a módosított baktériumokkal, mind a brokkolival táplált egereknél kevesebb és kisebb vastagbéldaganat alakult ki, mint azoknak a kitett egereknek, akiket 1) sem baktériummal, sem brokkolival, 2) csak baktériummal vagy 3) csak brokkolival tápláltak. Tervezett probiotikumok bárki?

Továbbá: szennyvízből olyan kulturált közösség alakult ki, amely képes csökkenteni az üvegházhatást okozó gáz N2O-tartalmát N2-re és segít enyhíteni a globális felmelegedést; a Daphnia mikrobiomák többsége nem szülőtől az utódokig jut, hanem felszívódik a környező környezetből; és a CRISPR-Cas9 szelekciós nyomás hatása a fág evolúciójára.