A bél mikrobiómájának és az étrend módosításának elemzése Crohn-betegségben szenvedő betegeknél

Easy Links

Cikk hivatkozások

Célkitűzés: Az emberi belekben billió milliárd kommenzális mikroba található, amelyek homeosztázisban élnek a gazda immunrendszerével. A gyulladásos bélbetegségben (IBD) a bélmikrobiális közösségek összetételének és összetettségének változásai figyelhetők meg, ami a gazda-mikroba kölcsönhatások megszakadását jelzi. Számos tényező, beleértve az étrendet és a gyulladásos állapotokat, megváltoztatja a mikrobiális összetettséget. A tanulmány célja egy optimalizált módszertan kidolgozása a székletminta feldolgozására és a speciális étrendben részesülő Crohn-betegségben szenvedő betegek bél mikrobiotájának változásainak kimutatására.

crohn-betegségben

Tervezés: Székletmintákat nyertek Crohn-betegségben szenvedő betegekből egy kísérleti diétás crossover vizsgálatban, amelyben összehasonlították egy adott szénhidrát-étrend (SCD) és az alacsony maradványtartalmú étrend (LRD) hatásait a bél mikrobiotájának összetételére és összetettségére, valamint az IBD tüneteinek feloldására. A bél mikrobiota összetételét nagy sűrűségű DNS-mikroarray PhyloChip alkalmazásával értékeltük.

Eredmények: A székletmintákból oszlopon alapuló módszerrel végzett DNS-kivonás következetes eredményeket hozott. A bél mikrobiómájának komplexitása alacsonyabb volt az IBD-s betegeknél az egészséges kontrollokhoz képest. Megnövekedett Bacteroides fragilis (B. fragilis) mennyiséget figyeltek meg IBD-pozitív betegek székletmintáiban. A bélmikrobiom időbeli válasza az SCD-re megnövekedett mikrobiális változatosságot eredményezett, míg az LRD diéta a mikrobaközösségek csökkent sokféleségével társult.

Következtetés: A bél mikrobiom összetételében és összetettségében bekövetkezett változásokat a speciális szénhidrát-étrendre válaszul azonosították. Az SCD a bél mikrobaközösségeinek szerkezetátalakításához társult.

Kulcsszavak: IBD; Crohn-betegség; Széklet mikrobioma; Diéta módosítása; PhyloChip

A probiotikumok, az étkezési szokások és a különféle tápanyagok bevitele megváltoztathatja a széklet mikroflóra profilját [12, 35-37]. A specifikus étrendek szerepet játszanak a Crohn-betegségben. Így erőfeszítéseket tettek speciális étrendek, például a Specifikus Szénhidrát Diéta (SCD) és az alacsony maradványtartalmú étrend (LRD) felhasználására a bél mikrobiomjának helyreállításához és a bél egészségének javításához [38-41]. Az SCD korlátozza a komplex szénhidrátok használatát, és 1955 óta évek óta szorgalmazzák a lisztérzékenység tüneti kezelésében [42-45]. Az LRD alacsony rosttartalmú étrend, és meghosszabbítja a béltranzit időt. Úgy vélték, hogy ez előnyös a Crohn-kór tüneteinek különböző eredménnyel való enyhítésében [46]. További vizsgálatokra van szükség, hogy betekintést nyerjünk az emberi mikrobiota bonyolultságába és dinamikájába a bélgyulladás kezelésére szolgáló különféle étrendek összefüggésében.

Ebben a tanulmányban a székletminták feldolgozásának több módszerét vizsgáltuk azok hasznosságára a széklet mikrobiom sokféleségének legjobb ábrázolása érdekében. A tanulmány célja a mikrobiom komplexitásának változásainak bemutatása volt a longitudinális székletmintákban az étrend módosítását követően, tenyésztéstől független, nagy sűrűségű mikro-sugarak, a 16S PhyloChip alkalmazásával. Megvizsgáltuk az IBD, valamint az SCD vagy LRD diéta módosításának hatását a bél mikrobiota szerkezetátalakítására.

Ezt a vizsgálatot részben annak megvizsgálására tervezték, hogy a DNS-extrakciós módszerek milyen hatással vannak az egészséges kontrollok és a Crohn-kóros betegek székletmikrobiómájának összetettségében bekövetkező változások kimutatására, valamint az étrendnek a bél mikrobiális komplexitásának helyreállítására gyakorolt ​​hatásainak vizsgálatára. Crohn-kórral. Az SCD-t és az LRD-t azért választották ki, hogy megvizsgálják a Crohn-kór klinikai tüneteinek enyhítésére gyakorolt ​​hatásukat. Korábbi anekdotikus jelentések az LRD széles körű alkalmazását javasolták a betegek számára, és a Crohn-kór klinikai tüneteinek fokozott enyhülését jelenthetik SCD alkalmazásával [47-49]. A résztvevőket beiratták az UC Davis Medical Center (Sacramento, Kalifornia) gyermek- és felnőtt IBD klinikáira az IRB által jóváhagyott protokollok szerint.