Határok a mikrobiológiában

Élelmiszer mikrobiológia

Ez a cikk a kutatási téma része

Az étrend, a bél mikrobiota és a gazdaszervezet metabolizmusa közötti kölcsönhatások Az összes 55 cikk megtekintése

Szerkesztette
Liwei Xie

Guangdongi Mikrobiológiai Intézet, Guangdongi Tudományos Akadémia, Kína

Felülvizsgálta
Chuan Wang

Auburn University, Egyesült Államok

Wei Lee

Guangdongi Mikrobiológiai Intézet, Guangdongi Tudományos Akadémia, Kína

A szerkesztő és a lektorok kapcsolatai a legfrissebbek a Loop kutatási profiljukban, és nem feltétlenül tükrözik a felülvizsgálat idején fennálló helyzetüket.

mycoplasma

  • Cikk letöltése
    • PDF letöltése
    • ReadCube
    • EPUB
    • XML (NLM)
    • Kiegészítő
      Anyag
  • Exportálás
    • EndNote
    • Referencia menedzser
    • Egyszerű TEXT fájl
    • BibTex
OSZD MEG

Eredeti kutatás CIKK

  • 1 Együttműködési Innovációs Központ a fertőző betegségek diagnosztizálásához és kezeléséhez, a fertőző betegségek diagnosztizálására és kezelésére szolgáló állami kulcslaboratórium, Az első kapcsolt kórház, Orvostudományi Kar, Zhejiang University, Hangzhou, Kína
  • 2 Gasztroenterológiai Osztály, a kapcsolt pekingi gyermekkórház, Capital Medical University, Peking, Kína
  • 3 Gyógyszerészeti Iskola, Senyang Gyógyszerészeti Egyetem, Senyang, Kína

Bevezetés

Kezelés

Valamennyi beteget intravénásan azitromicinnel kezeltek napi 10 mg/kg/nap dózisban naponta egyszer, 7 napig. Az azitromicin-kezelés harmadik napján a gyermekeket arra utasították, hogy az antibiotikum-kezelés után legalább 2 órával orálisan adják be a probiotikumokat a kórházból történő kivezetésig. A C. butyricum (CGMCC0313-1) kombinációja B. infantis (CGMCC0313-2) probiotikus keveréket (Changlekang®; Shandong Kexing Bioproducts Co., Ltd., Jinan, Kína) alkalmaztunk a potenciális AAD kezelésére. A fagyasztva szárított probiotikus keverék életképes értéke> 1,0 × 107 CFU/g volt C. butyricum és> 1 × 106 CFU/g életképes B. infantis kapszulánként. A probiotikumokkal kezelt gyermekek naponta háromszor 1500 mg-os dózist kaptak.

Minta kollekció

Az azitromicin-kezelés harmadik napján és a kórházi mentés napján friss bélsármintákat (kb. 2 g) és vérmintákat gyűjtöttünk minden gyermekből a bél mikrobiota és a bél nyálkahártya gát funkciójának elemzéséhez. Ezeket a mintákat azonnal a laboratóriumba vittük, és az elkészítést követően -80 ° C-on tároltuk 15 percen belül a felhasználásig.

Széklet baktérium genom DNS kivonása

A bakteriális genomi DNS-t QIAamp ® DNS Stool Mini Kit (Qiagen, Hilden, Németország) alkalmazásával extraháltuk korábbi tanulmányunk szerint (Ling et al., 2015). A bakteriális genom DNS mennyiségét NanoDrop ND-1000 spektrofotométerrel (Thermo Scientific, Wilmington, DE, Egyesült Államok) analizáltuk. A baktérium genomi DNS integritását és méretét elektroforézissel ellenőriztük. Az összes bakteriális genomi DNS-t -20 ° C-on tároltuk további felhasználás céljából.

Amplicon könyvtárépítés és nagy áteresztőképességű szekvenálás

Bioinformatikai elemzés

Bél nyálkahártya gát funkció elemzése

A bél nyálkahártya gátfunkciójának paramétereit, például a D-laktátot, az endotoxint (LPS) és a diamin-oxidázt (DAO) a bél nyálkahártya gátja biokémiai index elemző rendszer (JY-DLT; Beijing Zhongsheng Jinyu) száraz kémiai módszerével detektáltuk. Diagnostic Technology Co., Ltd., Peking, Kína). A gyulladáscsökkentő citokint, az interleukin 10-et (IL-10) a szérumban humán IL-10 immunvizsgálati készlet segítségével detektáltuk (eBioscience, San Diego, CA, Egyesült Államok). Az adatokat átlag ± szórásként (SD) mutatjuk be, és a két csoport közötti különbségeket Student's értékelte t-tesztelés SPSS használatával (20.0 verzió; SPSS, Inc., Chicago, IL, Egyesült Államok).

Statisztikai analízis

1.ábra. A széklet mikrobiotájának szerkezeti változásai probiotikus beavatkozás után Mycoplasma pneumoniae tüdőgyulladás (MPP). Sokszínűségi indexek, például Shannon (A) és Simpson (B), és gazdagsági indexek, például a megfigyelt fajok (C), Chao 1 (D), és az ACE (E) A probiotikus terápiát követően a széklet mikrobiota általános szerkezetének értékelésére használtuk. Az adatokat átlag ± szórásként adjuk meg. Párosítatlan t-teszteket (kétfarkú) alkalmaztunk a széklet mikrobiota variációinak elemzésére.

2. ábra. A széklet mikrobiota béta-diverzitás elemzése betegeknél Mycoplasma pneumoniae tüdőgyulladás probiotikus terápia után. Az egyes székletmikrobioták főkoordinátanalízisének (PCoA) diagramjai súlyozatlan UniFrac távolság alapján (A), súlyozott UniFrac távolság (B), Bray – Curtis távolság (C) és nem metrikus többdimenziós méretezés (NMDS) elemzés (D, stressz = 0,2211). Minden szimbólum egy mintát jelent. A Venn-diagram szemlélteti az OTU-k átfedését a széklet mikrobiotájában a kontroll, valamint a kezelés előtti és utáni csoportok között (E).

Idézet: Ling Z, Liu X, Guo S, Cheng Y, Shao L, Guan D, Cui X, Yang M és Xu X (2019) A probiotikumok szerepe Mycoplasma pneumoniae Tüdőgyulladás gyermekekben: rövid távú kísérleti projekt. Elülső. Microbiol. 9: 3261. doi: 10.3389/fmicb.2018.03261

Beérkezett: 2018. november 14 .; Elfogadva: 2018. december 14 .;
Publikálva: 2019. január 09.

Liwei Xie, Guangdongi Mikrobiológiai Intézet (CAS), Kína

Wei Lee, Guangdongi Mikrobiológiai Intézet (CAS), Kína
Chuan Wang, Auburn University, Egyesült Államok

† Ezek a szerzők egyformán járultak hozzá ehhez a munkához