Az emlőrákhoz, az étrendhez és a fizikai aktivitáshoz kapcsolódó modulált mikroRNS-ek azonosítása

A BC mintákban differenciálisan expresszált miRNS-ek a normál emlőszövetekhez képest, nyolc adatból legalább ötben. A differenciálanalízis eredményeit log2FC értékekként fejeztük ki, piros skála dobozokkal jelezve a felszabályozott miRNS-eket (Panel (A)), kék skála-dobozokkal pedig a downreguláltakat (Panel (B)). Az adatkészlet-azonosítókat az alkalmazott platform technológiától függően különböző színnel jelölték.

kapcsolódó

Panel (A): Differenciálisan expresszált miRNS-ek edzés előtt és után. Panel (B): Differenciálisan expresszált miRNS-ek diétás beavatkozások előtt és után. A kiválasztott adatkészletek legalább> 50% -ában közös miRNS-eket választottunk ki. A differenciálanalízis eredményeit log2FC értékekként fejeztük ki, piros skála dobozokkal jelezve az uregulált miRNS-eket, a kék skála dobozokkal pedig az alul szabályozottakat. Az adatkészlet-azonosítókat az alkalmazott platform technológiától függően különböző színnel jelölték. Félkövéren írják a miRNS-eket, amelyek szintén részt vesznek a Kr. E.

BC miRNS-ek és EMT gének mirDIP elemzése. Panel (A): A BC által szabályozott miRNS-ek és az EMT gének közötti kölcsönhatás. Panel (B): A BC-vel szabályozott miRNS-ek és az EMT-gén kölcsönhatása. A miRNS – gén kölcsönhatások intenzitása vörös színskála, a sárga (alacsony interakciós szintek) és a sötétvörös (nagyon magas interakciós szintek) tartományban. Minden EMT gént jelentenek a számítással kiválasztott BC miRNS-ekkel való kölcsönhatás szintjével.

Panel (A): Interakciós szintek az EMT gének és a testmozgással modulált miRNS-ek között. Panel (B): Interakciós szintek az EMT gének és a diéta által modulált miRNS-ek között. A miRNS – gén kölcsönhatások intenzitását vörös színskála szerint jelentik, a sárga (alacsony interakciós szint) és a sötétvörös (nagyon magas interakciós szint) tartományban. Minden EMT gén esetében meg kell adni a kölcsönhatás szintjét a számítás szerint kiválasztott BC miRNS-ekkel.

A kiválasztott miRNS-ek által megcélzott és az emlőrák KEGG útvonalában közvetlenül részt vevő 652 génből 61 STRING fehérje interakciós hálózat (hsa05224).

A STRING interakciós hálózat az étrend által modulált miRNS-ek által megcélzott gének között. Pirosak azok a gének, amelyek részt vesznek az emlőrák KEGG útvonalában (hsa05224).

A testmozgás és a diéta-miRNS által modulált gének STRING és Gene Ontology (GO) dúsítási elemzései. (A) A testmozgás által modulált gének a biológiai folyamat szerint csoportosítva; (B) testmozgás által modulált gének a molekuláris funkció szerint csoportosítva; (C) testmozgás által modulált gének a sejtkomponens szerint csoportosítva; (D) étrend által modulált gének, amelyek a biológiai folyamat szerint csoportosulnak; (E) a diéta által modulált gének a molekuláris funkció szerint csoportosítva; és (F) az étrend által modulált gének a sejtkomponens szerint csoportosítva.

A BC-vel szabályozott miRNS-ek prognosztikai értéke az OncoLnc szerint. Panel (A): A betegek túlélésével statisztikailag társított szabályozott miRNS-ek. A piros mezőben az a szabályozott miRNS található, amelynek expressziója nincs összhangban a túlélési görbékkel. Panel (B): a betegek túlélésével statisztikailag összefüggésben a BC miRNS csökkentett szabályozása.

A testmozgással modulált miRNS-ek prognosztikai értéke az OncoLnc szerint.